remove obsolete classes
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brianjlowe
parent
d3891fee3c
commit
2e7029b420
17 changed files with 3 additions and 790 deletions
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@ -1,45 +0,0 @@
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/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
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package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans;
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/**
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* TODO: jc55, Please put a description of this class and its intended use here.
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*
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*/
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public class Flagpole {
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private int index=0;
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/**
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* What is this the index of?
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* @return
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*/
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public int getIndex() { return index;}
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public void setIndex(int i) { index=i; }
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private int numeric=0;
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public int getNumeric() { return numeric; }
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public void setNumeric(int i) { numeric=i; }
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private String checkboxLabel=null;
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public String getCheckboxLabel() { return checkboxLabel; }
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public void setCheckboxLabel(String s) { checkboxLabel=s; }
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/**
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* What is this the status of?
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*/
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private String status="normal";
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public String getStatus() { return status; }
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public void setStatus(String s) { status=s; }
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/**
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* What is i, n and cLable?
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* @param i
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* @param n
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* @param cLabel
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*/
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public Flagpole(int i, int n, String cLabel) {
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index =i;
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numeric =n;
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checkboxLabel=cLabel;
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}
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}
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@ -1,62 +0,0 @@
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/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
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package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans;
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// TODO bjl23 this is the link method, nothing to do here, just drawing your attention to it.
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public class Link extends BaseResourceBean {
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private String url = null;
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private String anchor = null;
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private String entityURI = null;
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private String typeURI = null;
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private String displayRank = "-1";
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private ObjectPropertyStatement objectPropertyStatement = null;
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public String getAnchor() {
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return anchor;
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}
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public void setAnchor(String anchor) {
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||||||
this.anchor = anchor;
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}
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public String getEntityURI() {
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return entityURI;
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}
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public void setEntityURI(String entityURI) {
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||||||
this.entityURI = entityURI;
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||||||
}
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||||||
public String getTypeURI() {
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||||||
return typeURI;
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||||||
}
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||||||
public void setTypeURI(String typeURI) {
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||||||
this.typeURI = typeURI;
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||||||
}
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||||||
public String getUrl() {
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||||||
return url;
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||||||
}
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||||||
public void setUrl(String url) {
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||||||
this.url = url;
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}
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public String getDisplayRank() {
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||||||
return displayRank;
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}
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||||||
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||||||
public void setDisplayRank(int rank) {
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||||||
this.displayRank = String.valueOf(rank);
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||||||
}
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||||||
public void setDisplayRank(String rank) {
|
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||||||
this.displayRank = rank;
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||||||
/* try {
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||||||
this.displayRank = Integer.parseInt(rank);
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||||||
} catch (NumberFormatException ex) {
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||||||
this.displayRank = 10;
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} */
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||||||
}
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||||||
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||||||
public ObjectPropertyStatement getObjectPropertyStatement() {
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||||||
return objectPropertyStatement;
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||||||
}
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||||||
public void setObjectPropertyStatement(ObjectPropertyStatement op) {
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||||||
this.objectPropertyStatement = op;
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||||||
}
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||||||
}
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@ -1,24 +0,0 @@
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/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
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package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans;
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public class Linktype extends BaseResourceBean {
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private String type = null;
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private String generic = null;
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||||||
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||||||
public String getType() {
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return type;
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||||||
}
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||||||
public void setType(String type) {
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||||||
this.type = type;
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}
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||||||
public String getGeneric() {
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return generic;
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}
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||||||
public void setGeneric(String generic) {
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||||||
this.generic = generic;
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}
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}
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@ -1,45 +0,0 @@
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/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
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package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans;
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/**
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||||||
* a class representing a namespace for URI construction
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||||||
* @author bjl23
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*
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*/
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public class Namespace {
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private int id = -1;
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private String name = null;
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private String namespaceURI = null;
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private String prefix = null;
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public int getId() {
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||||||
return id;
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||||||
}
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public void setId(int id) {
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this.id = id;
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}
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||||||
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||||||
public String getName() {
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||||||
return name;
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||||||
}
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||||||
public void setName(String name) {
|
|
||||||
this.name = name;
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||||||
}
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public String getNamespaceURI() {
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||||||
return namespaceURI;
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||||||
}
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||||||
public void setNamespaceURI(String nsuri) {
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||||||
this.namespaceURI = nsuri;
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||||||
}
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||||||
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||||||
public String getPrefix() {
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||||||
return prefix;
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||||||
}
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||||||
public void setPrefix(String prefix) {
|
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||||||
this.prefix = prefix;
|
|
||||||
}
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|
||||||
|
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||||||
}
|
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||||||
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@ -1,173 +0,0 @@
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||||||
/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
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||||||
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|
||||||
package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.edit;
|
|
||||||
|
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||||||
import java.io.IOException;
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||||||
import java.net.URLEncoder;
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|
||||||
import java.util.Collection;
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||||||
import java.util.Date;
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||||||
import java.util.Iterator;
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||||||
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||||||
import javax.servlet.ServletException;
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||||||
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
|
|
||||||
import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
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||||||
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||||||
import org.apache.commons.logging.Log;
|
|
||||||
import org.apache.commons.logging.LogFactory;
|
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||||||
import org.joda.time.DateTime;
|
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||||||
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.LoginStatusBean;
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.controller.BaseEditController;
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.auth.requestedAction.Actions;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.auth.requestedAction.usepages.EditIndividuals;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Individual;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.PropertyInstance;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.VitroRequest;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.IndividualDao;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.PropertyInstanceDao;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.VitroVocabulary;
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|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.WebappDaoFactory;
|
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||||||
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||||||
/**
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||||||
* NOTE:does not work yet under semweb-align - gets tricky here
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||||||
* Takes an entity and inserts a (nearly) identical entity with a matching properties list.
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||||||
* NOTE (BJL23): This currently modifies the objects returned from the daos and calls inserts.
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||||||
If we go to a system of persistent in-memory objects, this method will need to be updated.
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||||||
* @author bjl23,jc55
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||||||
* */
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||||||
public class CloneEntityServlet extends BaseEditController {
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||||||
private static final String NO_PROPERTY_RESTRICTION = null;
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||||||
private static final int MIN_EDIT_ROLE=4;
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||||||
private static final Log log = LogFactory.getLog(CloneEntityServlet.class.getName());
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||||||
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||||||
public void doPost(HttpServletRequest req, HttpServletResponse response) {
|
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||||||
if (!isAuthorizedToDisplayPage(req, response, new Actions(new EditIndividuals()))) {
|
|
||||||
return;
|
|
||||||
}
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||||||
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||||||
VitroRequest request = new VitroRequest(req);
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||||||
try {
|
|
||||||
|
|
||||||
//attempt to clone a tab but if we don't find the parameter 'tabId' the clone a entity
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||||||
try{
|
|
||||||
int id = doCloneTab(request, response);
|
|
||||||
if( id >= 0){
|
|
||||||
response.sendRedirect("tabEdit?id=" + id);
|
|
||||||
return;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}catch(Exception ex){
|
|
||||||
log.error("Could not clone tab: " + ex);
|
|
||||||
getServletConfig().getServletContext().getRequestDispatcher(
|
|
||||||
"/index.jsp").forward(request,
|
|
||||||
response);
|
|
||||||
return;
|
|
||||||
}
|
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||||||
|
|
||||||
String individualURI=request.getParameter("uri");
|
|
||||||
if (individualURI == null || individualURI.equals("")){
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||||||
getServletConfig().getServletContext().getRequestDispatcher("/index.jsp").forward( request, response );
|
|
||||||
return;
|
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||||||
}
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||||||
|
|
||||||
LoginStatusBean loginBean = LoginStatusBean.getBean(request);
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|
||||||
WebappDaoFactory myWebappDaoFactory = request.getFullWebappDaoFactory().getUserAwareDaoFactory(loginBean.getUserURI());
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|
||||||
IndividualDao individualDao = myWebappDaoFactory.getIndividualDao();
|
|
||||||
PropertyInstanceDao propertyInstanceDao = myWebappDaoFactory.getPropertyInstanceDao();
|
|
||||||
|
|
||||||
Individual ind = individualDao.getIndividualByURI(individualURI);
|
|
||||||
if (ind == null){ log.error("Error retrieving individual "+individualURI); return; }
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|
||||||
String newName = request.getParameter("name");
|
|
||||||
if (newName != null && newName.length()>0) {
|
|
||||||
ind.setName(newName);
|
|
||||||
if (Character.isDigit(newName.charAt(0))) {
|
|
||||||
newName = "n"+newName;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
if (ind.getNamespace() != null) {
|
|
||||||
ind.setURI(ind.getNamespace()+newName.replaceAll("\\W",""));
|
|
||||||
} else {
|
|
||||||
ind.setURI(VitroVocabulary.vitroURI + newName.replaceAll("\\W",""));
|
|
||||||
}
|
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||||||
} else {
|
|
||||||
ind.setName("CLONE OF "+ind.getName());
|
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||||||
}
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||||||
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||||||
String cloneURI=individualDao.insertNewIndividual(ind);
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||||||
if (cloneURI == null){ log.error("Error inserting cloned individual"); return; }
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||||||
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||||||
Collection<PropertyInstance> PIColl=propertyInstanceDao.getExistingProperties(individualURI, NO_PROPERTY_RESTRICTION);
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||||||
Iterator<PropertyInstance> it=PIColl.iterator();
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||||||
while (it.hasNext()){
|
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||||||
PropertyInstance currPI=(PropertyInstance)it.next();
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||||||
currPI.setSubjectEntURI(cloneURI);
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||||||
propertyInstanceDao.insertProp(currPI);
|
|
||||||
}
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||||||
|
|
||||||
String encodedCloneURI = URLEncoder.encode(cloneURI, "UTF-8");
|
|
||||||
response.sendRedirect("entityEdit?uri="+encodedCloneURI);
|
|
||||||
//response.sendRedirect("entity?home="+portalIdStr+"&id="+newEntityId);
|
|
||||||
|
|
||||||
} catch (Exception ex) {
|
|
||||||
log.error( ex.getMessage() );
|
|
||||||
ex.printStackTrace();
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public Date parseStringToDate(String str) {
|
|
||||||
if (str.trim() == "") return null;
|
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||||||
int year, monthOfYear, dayOfMonth, hourOfDay, minuteOfHour;
|
|
||||||
try {
|
|
||||||
year = Integer.parseInt(str.substring(0,4));
|
|
||||||
monthOfYear = Integer.parseInt(str.substring(5,7));
|
|
||||||
dayOfMonth = Integer.parseInt(str.substring(8,10));
|
|
||||||
hourOfDay = Integer.parseInt(str.substring(11,13));
|
|
||||||
minuteOfHour = str.length()>13 ? Integer.parseInt(str.substring(14,16)) : 0;
|
|
||||||
if (str.length()>16) {
|
|
||||||
String suppStr = str.substring(17);
|
|
||||||
if (suppStr.equalsIgnoreCase("pm") || suppStr.equalsIgnoreCase("p.m.")) {
|
|
||||||
hourOfDay = hourOfDay < 12 ? hourOfDay + 12 : hourOfDay;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
log.warn("parsed clone timekey ["+str+"] to year: "+year+", month: "+monthOfYear+", day: "+dayOfMonth+", hour: "+hourOfDay+", minute: "+minuteOfHour);
|
|
||||||
} catch (NumberFormatException ex) {
|
|
||||||
log.error("Could not parse string "+str+" based on expected format 'yyyy-mm-dd hh-mm'");
|
|
||||||
return null;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
return new DateTime(year,monthOfYear,dayOfMonth,hourOfDay,minuteOfHour,0,0).toDate();
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
public void doGet(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response)
|
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||||||
throws ServletException, IOException {
|
|
||||||
doPost(request,response);
|
|
||||||
}
|
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||||||
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||||||
/**
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||||||
* Attempts to clone a tab.
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||||||
* This will check for the parameter 'tabId' and if it exists
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||||||
* this method will call cloneTabDb to do the actual database inserts.
|
|
||||||
* If no parameter is found then this method will return -1.
|
|
||||||
*
|
|
||||||
* @param request
|
|
||||||
* @param response
|
|
||||||
* @return tab id of newly cloned tab or -1 if no tabId parameter was found
|
|
||||||
* in the http request.
|
|
||||||
*/
|
|
||||||
private int doCloneTab(HttpServletRequest request,
|
|
||||||
HttpServletResponse response) throws Exception {
|
|
||||||
String tabIdStr = request.getParameter("tabId");
|
|
||||||
if (tabIdStr == null)
|
|
||||||
return -1;
|
|
||||||
|
|
||||||
int tabId = -1;
|
|
||||||
try {
|
|
||||||
tabId = Integer.parseInt(tabIdStr);
|
|
||||||
} catch (NumberFormatException ex) {
|
|
||||||
throw new Exception("error doCloneTab()-- could not parse "
|
|
||||||
+ tabIdStr + " as an integer value");
|
|
||||||
}
|
|
||||||
return 1; // getFacade().cloneTab(tabId);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
@ -1,141 +0,0 @@
|
||||||
/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
|
|
||||||
|
|
||||||
package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.edit;
|
|
||||||
|
|
||||||
import java.io.IOException;
|
|
||||||
|
|
||||||
import javax.servlet.RequestDispatcher;
|
|
||||||
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
|
|
||||||
import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
|
|
||||||
|
|
||||||
import org.apache.commons.logging.Log;
|
|
||||||
import org.apache.commons.logging.LogFactory;
|
|
||||||
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.EditProcessObject;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.FormObject;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.controller.BaseEditController;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.forwarder.PageForwarder;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.util.FormUtils;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.auth.requestedAction.Actions;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.auth.requestedAction.usepages.UseMiscellaneousAdminPages;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Namespace;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.Controllers;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.VitroRequest;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.NamespaceDao;
|
|
||||||
|
|
||||||
public class NamespaceRetryController extends BaseEditController {
|
|
||||||
|
|
||||||
private static final Log log = LogFactory.getLog(NamespaceRetryController.class.getName());
|
|
||||||
|
|
||||||
public void doPost (HttpServletRequest req, HttpServletResponse response) {
|
|
||||||
if (!isAuthorizedToDisplayPage(req, response, new Actions(new UseMiscellaneousAdminPages()))) {
|
|
||||||
return;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
VitroRequest request = new VitroRequest(req);
|
|
||||||
|
|
||||||
//create an EditProcessObject for this and put it in the session
|
|
||||||
EditProcessObject epo = super.createEpo(request);
|
|
||||||
|
|
||||||
/*for testing*/
|
|
||||||
Namespace testMask = new Namespace();
|
|
||||||
epo.setBeanClass(Namespace.class);
|
|
||||||
epo.setBeanMask(testMask);
|
|
||||||
|
|
||||||
String action = "insert";
|
|
||||||
if (request.getFullWebappDaoFactory() == null)
|
|
||||||
log.error("null CoreDaoFactory");
|
|
||||||
NamespaceDao namespaceDao = request.getFullWebappDaoFactory().getNamespaceDao();
|
|
||||||
//VitroFacade facade = getFacade();
|
|
||||||
//epo.setFacade(facade);
|
|
||||||
|
|
||||||
Namespace namespaceForEditing = null;
|
|
||||||
if (!epo.getUseRecycledBean()){
|
|
||||||
if (request.getParameter("id") != null) {
|
|
||||||
int id = Integer.parseInt(request.getParameter("id"));
|
|
||||||
if (id > 0) {
|
|
||||||
try {
|
|
||||||
namespaceForEditing = namespaceDao.getNamespaceById(id);
|
|
||||||
action = "update";
|
|
||||||
} catch (NullPointerException e) {
|
|
||||||
log.error("Need to implement 'record not found' error message.");
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
} else {
|
|
||||||
namespaceForEditing = new Namespace();
|
|
||||||
}
|
|
||||||
epo.setOriginalBean(namespaceForEditing);
|
|
||||||
} else {
|
|
||||||
namespaceForEditing = (Namespace) epo.getNewBean();
|
|
||||||
action = "update";
|
|
||||||
log.error("using newBean");
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
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||||||
//make a simple mask for the class's id
|
|
||||||
Object[] simpleMaskPair = new Object[2];
|
|
||||||
simpleMaskPair[0]="Id";
|
|
||||||
simpleMaskPair[1]=Integer.valueOf(namespaceForEditing.getId());
|
|
||||||
epo.getSimpleMask().add(simpleMaskPair);
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||||||
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||||||
//set up any listeners
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||||||
|
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||||||
//make a postinsert pageforwarder that will send us to a new class's fetch screen
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||||||
epo.setPostInsertPageForwarder(new NamespaceInsertPageForwarder());
|
|
||||||
//make a postdelete pageforwarder that will send us to the list of classes
|
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||||||
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||||||
//set the getMethod so we can retrieve a new bean after we've inserted it
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||||||
try {
|
|
||||||
Class[] args = new Class[1];
|
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||||||
args[0] = int.class;
|
|
||||||
epo.setGetMethod(namespaceDao.getClass().getDeclaredMethod("getNamespaceById",args));
|
|
||||||
} catch (NoSuchMethodException e) {
|
|
||||||
log.error("NamespaceRetryController could not find the namespaceById method in the facade");
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
FormObject foo = new FormObject();
|
|
||||||
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||||||
foo.setErrorMap(epo.getErrMsgMap());
|
|
||||||
|
|
||||||
epo.setFormObject(foo);
|
|
||||||
|
|
||||||
FormUtils.populateFormFromBean(namespaceForEditing,action,foo,epo.getBadValueMap());
|
|
||||||
|
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||||||
RequestDispatcher rd = request.getRequestDispatcher(Controllers.BASIC_JSP);
|
|
||||||
request.setAttribute("bodyJsp","/templates/edit/formBasic.jsp");
|
|
||||||
request.setAttribute("formJsp","/templates/edit/specific/namespace_retry.jsp");
|
|
||||||
request.setAttribute("scripts","/templates/edit/formBasic.js");
|
|
||||||
request.setAttribute("title","Namespace Editing Form");
|
|
||||||
request.setAttribute("_action",action);
|
|
||||||
request.setAttribute("unqualifiedClassName","Namespace");
|
|
||||||
setRequestAttributes(request,epo);
|
|
||||||
|
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||||||
try {
|
|
||||||
rd.forward(request, response);
|
|
||||||
} catch (Exception e) {
|
|
||||||
log.error("NamespaceRetryController could not forward to view.");
|
|
||||||
log.error(e.getMessage());
|
|
||||||
log.error(e.getStackTrace());
|
|
||||||
}
|
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||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void doGet (HttpServletRequest request, HttpServletResponse response) {
|
|
||||||
doPost(request, response);
|
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||||||
}
|
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||||||
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|
||||||
class NamespaceInsertPageForwarder implements PageForwarder {
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||||||
|
|
||||||
public void doForward(HttpServletRequest request, HttpServletResponse response, EditProcessObject epo){
|
|
||||||
String newNamespaceUrl = "fetch?queryspec=private_namespacev&postGenLimit=-1&linkwhere=namespaces.id=";
|
|
||||||
Namespace ns = (Namespace) epo.getNewBean();
|
|
||||||
newNamespaceUrl += ns.getId();
|
|
||||||
try {
|
|
||||||
response.sendRedirect(newNamespaceUrl);
|
|
||||||
} catch (IOException ioe) {
|
|
||||||
log.error("NamespaceInsertPageForwarder could not send redirect.");
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
@ -4,8 +4,6 @@ package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.edit;
|
||||||
|
|
||||||
import java.io.IOException;
|
import java.io.IOException;
|
||||||
import java.net.URLEncoder;
|
import java.net.URLEncoder;
|
||||||
import java.util.HashMap;
|
|
||||||
import java.util.List;
|
|
||||||
|
|
||||||
import javax.servlet.RequestDispatcher;
|
import javax.servlet.RequestDispatcher;
|
||||||
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
|
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
|
||||||
|
|
@ -16,7 +14,6 @@ import org.apache.commons.logging.LogFactory;
|
||||||
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.EditProcessObject;
|
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.EditProcessObject;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.FormObject;
|
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.FormObject;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.beans.Option;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.controller.BaseEditController;
|
import edu.cornell.mannlib.vedit.controller.BaseEditController;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.forwarder.PageForwarder;
|
import edu.cornell.mannlib.vedit.forwarder.PageForwarder;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vedit.forwarder.impl.UrlForwarder;
|
import edu.cornell.mannlib.vedit.forwarder.impl.UrlForwarder;
|
||||||
|
|
@ -26,7 +23,6 @@ import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.auth.requestedAction.usepages.EditOntolo
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Ontology;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Ontology;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.Controllers;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.Controllers;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.VitroRequest;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.VitroRequest;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.NamespaceDao;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
|
||||||
|
|
||||||
public class OntologyRetryController extends BaseEditController {
|
public class OntologyRetryController extends BaseEditController {
|
||||||
|
|
@ -52,7 +48,6 @@ public class OntologyRetryController extends BaseEditController {
|
||||||
|
|
||||||
OntologyDao oDao = request.getFullWebappDaoFactory().getOntologyDao();
|
OntologyDao oDao = request.getFullWebappDaoFactory().getOntologyDao();
|
||||||
epo.setDataAccessObject(oDao);
|
epo.setDataAccessObject(oDao);
|
||||||
NamespaceDao nDao = request.getFullWebappDaoFactory().getNamespaceDao();
|
|
||||||
|
|
||||||
Ontology ontologyForEditing = null;
|
Ontology ontologyForEditing = null;
|
||||||
if (!epo.getUseRecycledBean()){
|
if (!epo.getUseRecycledBean()){
|
||||||
|
|
@ -98,17 +93,6 @@ public class OntologyRetryController extends BaseEditController {
|
||||||
|
|
||||||
FormObject foo = new FormObject();
|
FormObject foo = new FormObject();
|
||||||
|
|
||||||
HashMap optionMap = new HashMap();
|
|
||||||
try {
|
|
||||||
List namespaceIdList = FormUtils.makeOptionListFromBeans(nDao.getAllNamespaces(),"Id","Name",Integer.valueOf(ontologyForEditing.getNamespaceId()).toString(),null,false);
|
|
||||||
namespaceIdList.add(0,new Option("-1","none", false));
|
|
||||||
optionMap.put("NamespaceId", namespaceIdList);
|
|
||||||
} catch (Exception e) {
|
|
||||||
log.error(this.getClass().getName());
|
|
||||||
e.printStackTrace();
|
|
||||||
}
|
|
||||||
foo.setOptionLists(optionMap);
|
|
||||||
|
|
||||||
foo.setErrorMap(epo.getErrMsgMap());
|
foo.setErrorMap(epo.getErrMsgMap());
|
||||||
|
|
||||||
epo.setFormObject(foo);
|
epo.setFormObject(foo);
|
||||||
|
|
|
||||||
|
|
@ -1,22 +0,0 @@
|
||||||
/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
|
|
||||||
|
|
||||||
package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao;
|
|
||||||
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Namespace;
|
|
||||||
|
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||||||
import java.util.List;
|
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||||||
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||||||
public interface NamespaceDao {
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||||||
public abstract List<Namespace> getAllNamespaces();
|
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||||||
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||||||
public abstract Namespace getNamespaceById(int namespaceId);
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||||||
int insertNewNamespace(Namespace namespace);
|
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||||||
void updateNamespace(Namespace ont);
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||||||
void deleteNamespace(int namespaceId);
|
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||||||
|
|
||||||
void deleteNamespace(Namespace namespace);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
@ -127,8 +127,6 @@ public interface WebappDaoFactory {
|
||||||
|
|
||||||
public PropertyGroupDao getPropertyGroupDao();
|
public PropertyGroupDao getPropertyGroupDao();
|
||||||
|
|
||||||
public NamespaceDao getNamespaceDao();
|
|
||||||
|
|
||||||
public PropertyInstanceDao getPropertyInstanceDao();
|
public PropertyInstanceDao getPropertyInstanceDao();
|
||||||
|
|
||||||
public PageDao getPageDao();
|
public PageDao getPageDao();
|
||||||
|
|
|
||||||
|
|
@ -14,7 +14,6 @@ import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DatatypeDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DisplayModelDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DisplayModelDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.IndividualDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.IndividualDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.MenuDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.MenuDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.NamespaceDao;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyStatementDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyStatementDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
|
||||||
|
|
@ -177,10 +176,6 @@ public class WebappDaoFactoryFiltering implements WebappDaoFactory {
|
||||||
return innerWebappDaoFactory.getDatatypeDao();
|
return innerWebappDaoFactory.getDatatypeDao();
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
public NamespaceDao getNamespaceDao() {
|
|
||||||
return innerWebappDaoFactory.getNamespaceDao();
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public OntologyDao getOntologyDao() {
|
public OntologyDao getOntologyDao() {
|
||||||
return innerWebappDaoFactory.getOntologyDao();
|
return innerWebappDaoFactory.getOntologyDao();
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
|
||||||
|
|
@ -1,98 +0,0 @@
|
||||||
/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
|
|
||||||
|
|
||||||
package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.jena;
|
|
||||||
|
|
||||||
import java.util.Iterator;
|
|
||||||
import java.util.List;
|
|
||||||
|
|
||||||
import org.apache.commons.logging.Log;
|
|
||||||
import org.apache.commons.logging.LogFactory;
|
|
||||||
|
|
||||||
import com.hp.hpl.jena.graph.Graph;
|
|
||||||
import com.hp.hpl.jena.graph.GraphEvents;
|
|
||||||
import com.hp.hpl.jena.graph.GraphListener;
|
|
||||||
import com.hp.hpl.jena.graph.Triple;
|
|
||||||
|
|
||||||
public class GraphSynchronizer implements GraphListener {
|
|
||||||
|
|
||||||
private static final Log log = LogFactory.getLog(GraphSynchronizer.class.getName());
|
|
||||||
|
|
||||||
private Graph g;
|
|
||||||
|
|
||||||
public GraphSynchronizer (Graph synchronizee) {
|
|
||||||
g = synchronizee;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyAddArray(Graph arg0, Triple[] arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().add(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyAddGraph(Graph arg0, Graph arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().add(arg1);
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyAddIterator(Graph arg0, Iterator arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().add(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyAddList(Graph arg0, List arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().add(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyAddTriple(Graph arg0, Triple arg1) {
|
|
||||||
g.add(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyDeleteArray(Graph arg0, Triple[] arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().delete(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyDeleteGraph(Graph arg0, Graph arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().delete(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyDeleteIterator(Graph arg0, Iterator arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().delete(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyDeleteList(Graph arg0, List arg1) {
|
|
||||||
g.getBulkUpdateHandler().delete(arg1);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyDeleteTriple(Graph arg0, Triple arg1) {
|
|
||||||
g.delete(arg1);
|
|
||||||
log.trace("Delete triple");
|
|
||||||
if (arg1.getObject().isLiteral()) {
|
|
||||||
log.trace(arg1.getObject().getLiteralLexicalForm());
|
|
||||||
} else if (arg1.getObject().isVariable()) {
|
|
||||||
log.trace("Triple object is variable");
|
|
||||||
} else if (arg1.getObject().isURI()) {
|
|
||||||
log.trace(arg1.getObject().getURI());
|
|
||||||
} else if (arg1.getObject().isBlank()) {
|
|
||||||
log.trace("Triple object is blank");
|
|
||||||
} else if (arg1.getObject().isConcrete()) {
|
|
||||||
log.trace("Triple object is concrete");
|
|
||||||
}
|
|
||||||
log.trace(arg1.getObject().toString());
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void notifyEvent(Graph arg0, Object arg1) {
|
|
||||||
// ontModel.removeAll(s,p,o) doesn't trigger a notifyDeleteTriple() !?!
|
|
||||||
// So, I'm doing this silly thing to make sure we see the deletion.
|
|
||||||
// What else is lurking around the corner?
|
|
||||||
if (arg1 instanceof GraphEvents) {
|
|
||||||
GraphEvents ge = ((GraphEvents) arg1);
|
|
||||||
Object content = ge.getContent();
|
|
||||||
if (ge.getTitle().equals("remove") && content instanceof Triple) {
|
|
||||||
notifyDeleteTriple( arg0, (Triple) content );
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
@ -9,6 +9,8 @@ import com.hp.hpl.jena.rdf.model.ModelChangedListener;
|
||||||
import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Statement;
|
import com.hp.hpl.jena.rdf.model.Statement;
|
||||||
import com.hp.hpl.jena.rdf.model.StmtIterator;
|
import com.hp.hpl.jena.rdf.model.StmtIterator;
|
||||||
|
|
||||||
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.jena.event.CloseEvent;
|
||||||
|
|
||||||
/**
|
/**
|
||||||
* Simple change listener to keep a model (the 'synchronizee') in synch with the model with which it is registered.
|
* Simple change listener to keep a model (the 'synchronizee') in synch with the model with which it is registered.
|
||||||
* @author bjl23
|
* @author bjl23
|
||||||
|
|
|
||||||
|
|
@ -1,47 +0,0 @@
|
||||||
/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
|
|
||||||
|
|
||||||
package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.jena;
|
|
||||||
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Namespace;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.NamespaceDao;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.WebappDaoFactory;
|
|
||||||
|
|
||||||
import java.util.HashSet;
|
|
||||||
import java.util.List;
|
|
||||||
|
|
||||||
import com.hp.hpl.jena.ontology.OntModel;
|
|
||||||
|
|
||||||
public class NamespaceDaoJena extends JenaBaseDao implements NamespaceDao {
|
|
||||||
|
|
||||||
public NamespaceDaoJena(WebappDaoFactoryJena wadf) {
|
|
||||||
super(wadf);
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void deleteNamespace(int namespaceId) {
|
|
||||||
// should be deprecated
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void deleteNamespace(Namespace namespace) {
|
|
||||||
// may not need/want to implement this
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public List<Namespace> getAllNamespaces() {
|
|
||||||
// TODO Auto-generated method stub
|
|
||||||
return null;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public Namespace getNamespaceById(int namespaceId) {
|
|
||||||
// should be deprecated
|
|
||||||
return null;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public int insertNewNamespace(Namespace namespace) {
|
|
||||||
// may not need/want to implement this
|
|
||||||
return 0;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
public void updateNamespace(Namespace ont) {
|
|
||||||
// may not need/want to implement this
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
@ -37,7 +37,6 @@ import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DatatypeDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DisplayModelDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DisplayModelDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.IndividualDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.IndividualDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.MenuDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.MenuDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.NamespaceDao;
|
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyStatementDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyStatementDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
|
||||||
|
|
@ -349,13 +348,6 @@ public class WebappDaoFactoryJena implements WebappDaoFactory {
|
||||||
return individualDao;
|
return individualDao;
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
NamespaceDao namespaceDao = null;
|
|
||||||
public NamespaceDao getNamespaceDao() {
|
|
||||||
if( namespaceDao == null )
|
|
||||||
namespaceDao = new NamespaceDaoJena(this);
|
|
||||||
return namespaceDao;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
ObjectPropertyStatementDao objectPropertyStatementDao = null;
|
ObjectPropertyStatementDao objectPropertyStatementDao = null;
|
||||||
public ObjectPropertyStatementDao getObjectPropertyStatementDao() {
|
public ObjectPropertyStatementDao getObjectPropertyStatementDao() {
|
||||||
if( objectPropertyStatementDao == null )
|
if( objectPropertyStatementDao == null )
|
||||||
|
|
|
||||||
|
|
@ -1,6 +1,6 @@
|
||||||
/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
|
/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
|
||||||
|
|
||||||
package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.jena;
|
package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.jena.event;
|
||||||
|
|
||||||
public class CloseEvent {
|
public class CloseEvent {
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// used to close synchronized models via Jena's event system
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// used to close synchronized models via Jena's event system
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@ -1,94 +0,0 @@
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/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */
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package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.utils;
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import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.DataPropertyStatement;
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import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Individual;
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import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.beans.Link;
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import java.util.List;
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import java.util.regex.Matcher;
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import java.util.regex.Pattern;
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/**
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* makes a cornell library openUrl for
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* an entity using info found in DataProps.
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*
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* @author bdc34
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*
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*/
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public class OpenUrlMaker {
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//These are datapropIds that are acceptable values for the given field
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private int atitle[] = {36};
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private int spage[] = {39};
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private int aulast[] = {};
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private int issue[] = {53};
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||||||
private int volume[] = {54};
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private int auint[] = {};
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private int doi[] = {55};
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private int aufull[] = {44};
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private Pattern spage_regex = Pattern.compile("[^0-9]*([0-9]+)[^0-9]*.*");
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//private Pattern spage_regex = Pattern.compile("([0-9]*)[^0-9]*([0-9]*)[^0-9]*.*");
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private Pattern aulast_regex = Pattern.compile("([^\\s]*)[\\s]*.*");
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private Pattern firstNumer_regex = Pattern.compile("[^0-9]*([0-9]+)[^0-9]*.*");
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/**
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* Uses the DatatypeProperty objects for the Entity
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* to make a OpenURL for the Cornell library resolver.
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*
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* @param ent
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* @return returns Link object if one can be made, null otherwise.
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*/
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public Link makeOpenUrlForEntity(Individual ent){
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Link oUrl = null;
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String atitle = null;
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String spage = null;
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String aulast = null;
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String issue = null;
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String volume = null;
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String auint = null;
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String doi = null;
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String aufull = null;
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List <DataPropertyStatement> dataPropertyStmts = ent.getDataPropertyStatements();
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for( DataPropertyStatement dataPropertyStmt : dataPropertyStmts){
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if( found( this.atitle, dataPropertyStmt ) ){
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atitle = escape(dataPropertyStmt.getData());
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} else
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if( found( this.spage, dataPropertyStmt ) ){
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Matcher m = this.spage_regex.matcher(dataPropertyStmt.getData());
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if( m.matches() && m.groupCount() > 0 )
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spage = m.group(1);
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} else
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if( found( this.aulast, dataPropertyStmt ) ){
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||||||
Matcher m = this.aulast_regex.matcher(dataPropertyStmt.getData());
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||||||
if( m.matches() && m.groupCount() > 0 )
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aulast = m.group(1);
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} else
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if( found( this.issue, dataPropertyStmt ) ){
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Matcher m = this.firstNumer_regex.matcher(dataPropertyStmt.getData());
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||||||
if( m.matches() && m.groupCount() > 0 )
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issue = m.group(1);
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} else
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if( found( this.volume, dataPropertyStmt ) ){
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} else if( found( this.auint, dataPropertyStmt ) ){
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} else if( found( this.doi, dataPropertyStmt ) ){
|
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} else if( found( this.aufull, dataPropertyStmt ) ){
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}
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}
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return oUrl;
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}
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private boolean found( int[] ids, DataPropertyStatement dataPropertyStmt){
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return true;
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}
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private String escape(String in){
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return in;
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}
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}
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@ -14,7 +14,6 @@ import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DatatypeDao;
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import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DisplayModelDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.DisplayModelDao;
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.IndividualDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.IndividualDao;
|
||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.MenuDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.MenuDao;
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.NamespaceDao;
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyDao;
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import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyDao;
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyStatementDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.ObjectPropertyStatementDao;
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||||||
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
|
import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.OntologyDao;
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@ -200,12 +199,6 @@ public class WebappDaoFactoryStub implements WebappDaoFactory {
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"WebappDaoFactory.getPropertyGroupDao() not implemented.");
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"WebappDaoFactory.getPropertyGroupDao() not implemented.");
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}
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}
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@Override
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public NamespaceDao getNamespaceDao() {
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throw new RuntimeException(
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"WebappDaoFactory.getNamespaceDao() not implemented.");
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}
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@Override
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@Override
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public PropertyInstanceDao getPropertyInstanceDao() {
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public PropertyInstanceDao getPropertyInstanceDao() {
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throw new RuntimeException(
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throw new RuntimeException(
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