data migration work

productMods/WEB-INF/ontologies/update/askUpdated.sparql

@@ -3,9 +3,6 @@ PREFIX owl:   <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
 PREFIX rdf:   <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
 
 ASK {
-    graph <http://vitro.mannlib.cornell.edu/default/vitro-kb-applicationMetadata> {
        <http://vitro.mannlib.cornell.edu/default/vitro-kb-2> vitro:updatedToOntology ?u .
-       ?u vitro:updatedOntology <http://vivoweb.org/ontology/core> .
        ?u vitro:toOntologyVersion "1.6" .
-    }
 }

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/AdvisingRelationship.sparql

@@ -3,7 +3,7 @@ PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#Thing>
 PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
 
 CONSTRUCT {
-    ?advisee <ihttp://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:AdviseeRole .
+    ?advisee <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:AdviseeRole .
     _:AdviseeRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?advisee .
     _:AdviseeRole a vivo:AdviseeRole .
     ?advisor <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:AdvisorRole .

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/LeaderRole.sparql

@@ -0,0 +1,15 @@
+PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#> 
+PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#Thing> 
+PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
+
+CONSTRUCT {
+    ?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:leaderRole .
+    _:leaderRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?person .
+    _:leaderRole a vivo:LeaderRole .
+    _:leaderRole vivo:roleContributesTo ?org .
+    ?org vivo:contributingRole _:leaderRole .
+} WHERE {
+    { ?person vivo:currentlyHeadOf ?org }
+      UNION 
+    { ?org vivo:currentlyHeadedBy ?person }
+}

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/MemberRole.sparql

@@ -0,0 +1,15 @@
+PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#> 
+PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#Thing> 
+PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
+
+CONSTRUCT {
+    ?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:memberRole .
+    _:memberRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?person .
+    _:memberRole a vivo:MemberRole .
+    _:memberRole vivo:roleContributesTo ?org .
+    ?org vivo:contributingRole _:memberRole .
+} WHERE {
+     {  ?person vivo:currentMemberOf ?org }
+       UNION 
+     { ?org vivo:hasCurrentMember ?person }
+}

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/grantAdmin.sparql

@@ -0,0 +1,17 @@
+PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#> 
+PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#Thing> 
+PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
+
+CONSTRUCT {
+    ?agent <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:adminRole .
+    _:adminRole a vivo:AdministratorRole .
+    _:adminRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?agent .
+    _:adminRole vivo:relatedBy ?grant .
+    ?grant vivo:relates _:adminRole .
+    ?grant vivo:relates ?agent .
+    ?agent vivo:relatedBy ?grant .
+} WHERE {
+    { ?agent vivo:administers ?grant }
+      UNION
+    { ?grant vivo:administeredBy ?agent }
+}

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/post/Grant.sparql

@@ -6,7 +6,7 @@ CONSTRUCT {
     ?agent vivo:relatedBy ?grant .
     ?grant vivo:relates ?agent
 } WHERE {
-    ?agent <ihttp://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?role .
+    ?agent <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?role .
     ?role vivo:relatedBy ?grant
     FILTER NOT EXISTS { ?grant vivo:relates ?agent } 
 }

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/post/awardedDegree.sparql

@@ -12,6 +12,8 @@ CONSTRUCT {
     ?person vivo:relatedBy _:awardedDegree .
     _:awardedDegree vivo:assignedBy ?org .
     ?org vivo:assigns _:awardedDegree .
+    ?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000055> ?role .
+    ?role <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000054> ?educationalProcess .
 } WHERE {
     ?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000056> ?educationalProcess .
     ?educationalProcess a vivo:EducationalProcess .
@@ -21,4 +23,9 @@ CONSTRUCT {
         ?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000057> ?org . 
         ?org a foaf:Organization 
     }
+    OPTIONAL {
+        ?educationalProcess vivo:contributingAdvising ?advising .
+        ?advising vivo:relates ?role .
+        ?role a <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000023> .
+    }
 }

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard22.sparql

@@ -0,0 +1,14 @@
+PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/> 
+PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/> 
+PREFIX v:   <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#> 
+PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#> 
+PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
+
+CONSTRUCT {
+    ?vcard v:hasTitle _:title .
+    _:title a v:Title .
+    _:title v:title ?preferredTitle .
+} WHERE {
+     ?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
+     ?s <http://vivoweb.org/ontology/core#preferredTitle> ?preferredTitle .
+}

productMods/WEB-INF/ontologies/update/success.n3

@@ -2,9 +2,9 @@
 @prefix owl:   <http://www.w3.org/2002/07/owl#> .
 @prefix rdf:   <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
 
-<http://vitro.mannlib.cornell.edu/default/vitro-kb-2> vitro:updatedToOntology <http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.5> .
+<http://vitro.mannlib.cornell.edu/default/vitro-kb-2> vitro:updatedToOntology <http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.6> .
-<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.5> rdf:type owl:Thing .
+<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.6> rdf:type owl:Thing .
-<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.5> vitro:updatedOntology <http://vivoweb.org/ontology/core> .
+<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.6> vitro:updatedOntology <http://vivoweb.org/ontology/core> .
-<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.5> vitro:fromOntologyVersion "1.5" .
+<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.6> vitro:fromOntologyVersion "1.5" .
-<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.5> vitro:toOntologyVersion "1.6" .
+<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/metadata/migration/v1.6> vitro:toOntologyVersion "1.6" .
  

rdf/tbox/filegraph/object-properties.owl

@@ -1117,6 +1117,7 @@ there is a measurement process p that has specified output m, a measurement datu
 
     <owl:ObjectProperty rdf:about="http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002350">
         <rdfs:label xml:lang="en">member of</rdfs:label>
+        <owl:inverseOf rdf:resource="http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002351"/>
     </owl:ObjectProperty>
     
 
@@ -1125,8 +1126,6 @@ there is a measurement process p that has specified output m, a measurement datu
 
     <owl:ObjectProperty rdf:about="http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002351">
         <rdfs:label xml:lang="en">has_member</rdfs:label>
-        <rdfs:domain rdf:resource="http://xmlns.com/foaf/0.1/Organization"/>
-        <rdfs:range rdf:resource="http://xmlns.com/foaf/0.1/Person"/>
     </owl:ObjectProperty>