From 812e07baea686aa1cf644ab69dd459874577526a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: tworrall Date: Wed, 13 Nov 2013 11:36:45 -0500 Subject: [PATCH 01/46] VIVO-525: setting type on new journals --- .../edit/forms/js/publicationToPersonUtils.js | 10 +++++----- .../generators/AddPublicationToPersonGenerator.java | 4 ++-- 2 files changed, 7 insertions(+), 7 deletions(-) diff --git a/productMods/templates/freemarker/edit/forms/js/publicationToPersonUtils.js b/productMods/templates/freemarker/edit/forms/js/publicationToPersonUtils.js index bd622114..94deb69d 100644 --- a/productMods/templates/freemarker/edit/forms/js/publicationToPersonUtils.js +++ b/productMods/templates/freemarker/edit/forms/js/publicationToPersonUtils.js @@ -148,7 +148,7 @@ var publicationToPersonUtils = { this.hideAllFields(); var selectedType = this.typeSelector.find(':selected').text(); - if ( selectedType == 'Academic Article' || selectedType == 'Article' || selectedType == 'Editorial Article' || selectedType == 'Review') { + if ( selectedType == 'Academic Article' ) { // if the user has changed type, keep any relevant values and display the // acSelection as appropriate var ckForVal = this.getAcUriReceiverVal('collection'); @@ -273,10 +273,6 @@ var publicationToPersonUtils = { else if ( selectedType == 'Conference Paper' ) { // if the user has changed type, keep any relevant values and display the // acSelection as appropriate - var ckForVal = this.getAcUriReceiverVal('collection'); - if ( ckForVal == '' || ckForVal == this.sentinel ) { - this.collection.parent('p').show(); - } ckForVal = this.getAcUriReceiverVal('conference'); if ( ckForVal == '' || ckForVal == this.sentinel ) { this.presentedAt.parent('p').show(); @@ -287,6 +283,10 @@ var publicationToPersonUtils = { // if the user is changing type, ensure that irrelevant fields are cleared // and reset an acSelection divs + if ( this.collection.val() != '' && this.collection.val().substring(0, 18) != publicationToPersonUtils.selectAnExisting ) { + this.collection.val(''); + this.resetAcSelection('collection'); + } if ( this.book.val() != '' && this.book.val().substring(0, 18) != publicationToPersonUtils.selectAnExisting ) { this.book.val(''); this.resetAcSelection('book'); diff --git a/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/AddPublicationToPersonGenerator.java b/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/AddPublicationToPersonGenerator.java index d5eaf054..7c6be1e6 100644 --- a/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/AddPublicationToPersonGenerator.java +++ b/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/AddPublicationToPersonGenerator.java @@ -44,7 +44,7 @@ import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.utils.generators.EditModeUtils; */ public class AddPublicationToPersonGenerator extends VivoBaseGenerator implements EditConfigurationGenerator { - final static String collectionClass = bibo + "Periodical"; + final static String collectionClass = bibo + "Journal"; final static String bookClass = bibo + "Book"; final static String documentClass = "http://purl.obolibrary.org/obo/IAO_0000030"; final static String conferenceClass = bibo + "Conference"; @@ -241,7 +241,7 @@ public class AddPublicationToPersonGenerator extends VivoBaseGenerator implement private String getN3ForNewCollectionNewPub() { return "@prefix vivo: <" + vivoCore + "> . \n" + "?newPublication vivo:hasPublicationVenue ?newCollection . \n" + - "?newCollection a <" + collectionClass + "> . \n" + + "?newCollection a <" + collectionClass + "> . \n" + "?newCollection vivo:publicationVenueFor ?newPublication . \n" + "?newCollection <" + label + "> ?collection ."; } From 65b13dc91d9dc2043002aaf83a18a7a8df73eb63 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: tworrall Date: Wed, 13 Nov 2013 13:33:47 -0500 Subject: [PATCH 02/46] organization property changes including new custom form et al (VIVO-518) --- .../themes/wilma/i18n/all_es.properties | 4 +- ...iewConfig-organizationAdministersGrant.xml | 55 +++++++ ...Statement-organizationAdministersGrant.ftl | 26 ++++ .../forms/organizationAdministersGrant.ftl | 136 ++++++++++++++++++ rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 | 21 ++- .../GrantAdministeredByGenerator.java | 8 +- ...OrganizationAdministersGrantGenerator.java | 127 ++++++++++++++++ themes/wilma/i18n/all.properties | 4 +- 8 files changed, 374 insertions(+), 7 deletions(-) create mode 100644 productMods/config/listViewConfig-organizationAdministersGrant.xml create mode 100644 productMods/templates/freemarker/body/partials/individual/propStatement-organizationAdministersGrant.ftl create mode 100644 productMods/templates/freemarker/edit/forms/organizationAdministersGrant.ftl create mode 100644 src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/OrganizationAdministersGrantGenerator.java diff --git a/languages/example/themes/wilma/i18n/all_es.properties b/languages/example/themes/wilma/i18n/all_es.properties index 0b02b0cc..d71660c0 100644 --- a/languages/example/themes/wilma/i18n/all_es.properties +++ b/languages/example/themes/wilma/i18n/all_es.properties @@ -873,4 +873,6 @@ edit_publication_date = Editar fecha de publicación name_prefix = Prefijo de nombre name_suffix = Sufijo de nombre administering_organization_for = administración de la organización para -missing_credential = falta credencial \ No newline at end of file +missing_credential = falta credencial +grant_administered_by = conceder administrado por +missing_grant = falta de subvención \ No newline at end of file diff --git a/productMods/config/listViewConfig-organizationAdministersGrant.xml b/productMods/config/listViewConfig-organizationAdministersGrant.xml new file mode 100644 index 00000000..3e3bbfe8 --- /dev/null +++ b/productMods/config/listViewConfig-organizationAdministersGrant.xml @@ -0,0 +1,55 @@ + + + + + + + + PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/> + PREFIX core: <http://vivoweb.org/ontology/core#> + PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> + PREFIX obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/> + + SELECT DISTINCT ?administratorRole + ?grant + ?grantLabel + + WHERE { + ?subject ?property ?administratorRole . + ?administratorRole a core:AdministratorRole . + OPTIONAL { ?administratorRole core:relatedBy ?grant . + ?grant core:relates ?administratorRole . + ?grant rdfs:label ?grantLabel . + } + } ORDER BY ?grantLabel + + + + PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/> + PREFIX core: <http://vivoweb.org/ontology/core#> + PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> + PREFIX obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/> + + CONSTRUCT { + ?subject ?property ?administratorRole . + ?administratorRole a core:AdministratorRole . + ?administratorRole core:relatedBy ?grant . + ?grant core:relates ?administratorRole . + ?grant rdfs:label ?grantLabel . + } WHERE { + { + ?subject ?property ?administratorRole . + ?administratorRole a core:AdministratorRole . + } UNION { + ?subject ?property ?administratorRole . + ?administratorRole a core:AdministratorRole . + ?administratorRole core:relatedBy ?grant . + ?grant a core:Grant . + ?grant core:relates ?administratorRole . + ?grant rdfs:label ?grantLabel . + } + } + + + + diff --git a/productMods/templates/freemarker/body/partials/individual/propStatement-organizationAdministersGrant.ftl b/productMods/templates/freemarker/body/partials/individual/propStatement-organizationAdministersGrant.ftl new file mode 100644 index 00000000..61fbe996 --- /dev/null +++ b/productMods/templates/freemarker/body/partials/individual/propStatement-organizationAdministersGrant.ftl @@ -0,0 +1,26 @@ +<#-- $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ --> + +<#-- + + This template must be self-contained and not rely on other variables set for the individual page, because it + is also used to generate the property statement during a deletion. + --> +<#import "lib-sequence.ftl" as s> +<#import "lib-datetime.ftl" as dt> +<@showAdministeredGrant statement /> + +<#-- Use a macro to keep variable assignments local; otherwise the values carry over to the + next statement --> +<#macro showAdministeredGrant statement> + + <#local linkedIndividual> + <#if statement.grant??> + ${statement.grantLabel!""} + <#else> + ${i18n().missing_grant} + + + + ${linkedIndividual!} + + diff --git a/productMods/templates/freemarker/edit/forms/organizationAdministersGrant.ftl b/productMods/templates/freemarker/edit/forms/organizationAdministersGrant.ftl new file mode 100644 index 00000000..82dd7d3c --- /dev/null +++ b/productMods/templates/freemarker/edit/forms/organizationAdministersGrant.ftl @@ -0,0 +1,136 @@ +<#-- $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ --> + +<#-- this is in request.subject.name --> + +<#-- leaving this edit/add mode code in for reference in case we decide we need it --> + +<#import "lib-vivo-form.ftl" as lvf> + +<#--Retrieve certain edit configuration information--> +<#if editConfiguration.objectUri?has_content> + <#assign editMode = "edit"> +<#else> + <#assign editMode = "add"> + + +<#--The blank sentinel indicates what value should be put in a URI when no autocomplete result has been selected. +If the blank value is non-null or non-empty, n3 editing for an existing object will remove the original relationship +if nothing is selected for that object--> +<#assign blankSentinel = "" /> +<#if editConfigurationConstants?has_content && editConfigurationConstants?keys?seq_contains("BLANK_SENTINEL")> + <#assign blankSentinel = editConfigurationConstants["BLANK_SENTINEL"] /> + + +<#--This flag is for clearing the label field on submission for an existing object being selected from autocomplete. +Set this flag on the input acUriReceiver where you would like this behavior to occur. --> +<#assign flagClearLabelForExisting = "flagClearLabelForExisting" /> + +<#assign htmlForElements = editConfiguration.pageData.htmlForElements /> + +<#--Retrieve variables needed--> +<#assign existingGrantValue = lvf.getFormFieldValue(editSubmission, editConfiguration, "existingGrant") /> +<#assign grantLabelValue = lvf.getFormFieldValue(editSubmission, editConfiguration, "grantLabel") /> +<#assign grantLabelDisplayValue = lvf.getFormFieldValue(editSubmission, editConfiguration, "grantLabelDisplay") /> + +<#--If edit submission exists, then retrieve validation errors if they exist--> +<#if editSubmission?has_content && editSubmission.submissionExists = true && editSubmission.validationErrors?has_content> + <#assign submissionErrors = editSubmission.validationErrors/> + + +<#if editMode == "edit"> + <#assign titleVerb="${i18n().edit_capitalized}"> + <#assign submitButtonText="${i18n().save_changes}"> + <#assign disabledVal="disabled"> +<#else> +<#assign titleVerb="${i18n().create_capitalized}"> +<#assign submitButtonText="${i18n().create_entry}"> + <#assign disabledVal=""/> + + +<#assign requiredHint = " *" /> + +

${titleVerb} ${i18n().grant_administered_by} ${editConfiguration.subjectName}

+ +<#--Display error messages if any--> +<#if submissionErrors?has_content> + <#if grantLabelDisplayValue?has_content > + <#assign grantLabelValue = grantLabelDisplayValue /> + + + + + +<@lvf.unsupportedBrowser urls.base /> + +
+ +
+

+ + + +

+ +
+

+ + + (${i18n().verify_match_capitalized} ${i18n().or} + ${i18n().change_selection}) +

+ +
+ <#assign htmlForElements = editConfiguration.pageData.htmlForElements /> + + + +

+ ${i18n().or} + ${i18n().cancel_link} +

+ +

* ${i18n().required_fields}

+ + +
+ + + + + +${stylesheets.add('')} +${stylesheets.add('')} +${stylesheets.add('')} + +${scripts.add('', + '', + '', + '', + '', + '')} + + + diff --git a/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 b/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 index 1dc86915..11b83213 100644 --- a/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 +++ b/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 @@ -489,8 +489,8 @@ local:organizationForTrainingConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; :listViewConfigFile "listViewConfig-organizationForTraining.xml"^^xsd:string ; :displayName "organization for training" ; vitro:displayRankAnnot 1; - vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; - vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:nobody ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:nobody ; vitro:customEntryFormAnnot "edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.configuration.generators.OrganizationForTrainingGenerator"^^ ; :propertyGroup . @@ -601,6 +601,21 @@ local:grantAdministeredByConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; vitro:customEntryFormAnnot "edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.configuration.generators.GrantAdministeredByGenerator"^^ ; :propertyGroup . +local:orgAdministersGrantContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:orgAdministersGrantConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain ; + :qualifiedBy vivo:AdministratorRole . + +local:orgAdministersGrantConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-organizationAdministersGrant.xml"^^xsd:string ; + :displayName "administers grant" ; + vitro:displayRankAnnot 61; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:customEntryFormAnnot "edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.configuration.generators.OrganizationAdministersGrantGenerator"^^ ; + :propertyGroup . + ### vcard properties ### local:mailingAddressContext a :ConfigContext ; @@ -1114,7 +1129,7 @@ local:awardOrHonorGivenConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; local:orgAwardsGrantContext a :ConfigContext ; :hasConfiguration local:orgAwardsGrantConfig ; - :configContextFor ; + :configContextFor ; :qualifiedByDomain ; :qualifiedBy . diff --git a/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/GrantAdministeredByGenerator.java b/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/GrantAdministeredByGenerator.java index 8fea8fd4..a418c2e7 100644 --- a/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/GrantAdministeredByGenerator.java +++ b/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/GrantAdministeredByGenerator.java @@ -85,7 +85,7 @@ public class GrantAdministeredByGenerator extends VivoBaseGenerator implements /* N3 assertions */ final static String n3ForNewAdminRole = - "@prefix vivo: <" + vivoCore + "> . \n\n" + + "@prefix vivo: <" + vivoCore + "> . \n" + "?grant vivo:relates ?adminRole . \n" + "?adminRole a vivo:AdministratorRole . \n" + "?adminRole vivo:relatedBy ?grant . " ; @@ -95,13 +95,17 @@ public class GrantAdministeredByGenerator extends VivoBaseGenerator implements "?adminRole ?newOrganization . \n" + "?newOrganization a . \n" + "?newOrganization ?adminRole . \n" + + "?newOrganization vivo:relatedBy ?grant . \n" + + "?grant vivo:relates ?newOrganization . \n" + "?newOrganization <"+ label + "> ?orgLabel ."; final static String n3ForExistingAdminOrganization = "@prefix vivo: <" + vivoCore + "> . \n\n" + "?adminRole ?existingOrganization . \n" + "?existingOrganization a . \n" + - "?existingOrganization ?adminRole . " ; + "?existingOrganization ?adminRole . " + + "?existingOrganization vivo:relatedBy ?grant . \n" + + "?grant vivo:relates ?existingOrganization . \n" ; /* Queries for editing an existing entry */ diff --git a/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/OrganizationAdministersGrantGenerator.java b/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/OrganizationAdministersGrantGenerator.java new file mode 100644 index 00000000..0d598914 --- /dev/null +++ b/src/edu/cornell/mannlib/vitro/webapp/edit/n3editing/configuration/generators/OrganizationAdministersGrantGenerator.java @@ -0,0 +1,127 @@ +/* $This file is distributed under the terms of the license in /doc/license.txt$ */ + +package edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.configuration.generators; + +import java.util.Arrays; +import java.util.HashMap; +import java.util.Map; + +import javax.servlet.http.HttpSession; + +import com.hp.hpl.jena.vocabulary.XSD; + +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.controller.VitroRequest; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.dao.VitroVocabulary; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.AutocompleteRequiredInputValidator; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.DateTimeIntervalValidationVTwo; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.DateTimeWithPrecisionVTwo; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.EditConfigurationVTwo; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.fields.ChildVClassesWithParent; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.fields.ConstantFieldOptions; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.fields.FieldOptions; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.fields.FieldVTwo; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.VTwo.fields.IndividualsViaVClassOptions; +import edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.edit.n3editing.configuration.validators.AntiXssValidation; + +public class OrganizationAdministersGrantGenerator extends VivoBaseGenerator implements + EditConfigurationGenerator { + + public OrganizationAdministersGrantGenerator() {} + + @Override + public EditConfigurationVTwo getEditConfiguration(VitroRequest vreq, + HttpSession session) throws Exception { + + EditConfigurationVTwo conf = new EditConfigurationVTwo(); + + initBasics(conf, vreq); + initPropertyParameters(vreq, session, conf); + initObjectPropForm(conf, vreq); + + conf.setTemplate("organizationAdministersGrant.ftl"); + + conf.setVarNameForSubject("organization"); + conf.setVarNameForPredicate("predicate"); + conf.setVarNameForObject("adminRole"); + + conf.setN3Required( Arrays.asList( n3ForNewAdminRole) ); + conf.setN3Optional( Arrays.asList( n3ForNewAdminGrant, + n3ForExistingAdminGrant ) ); + + conf.addNewResource("newGrant", DEFAULT_NS_FOR_NEW_RESOURCE); + conf.addNewResource("adminRole", DEFAULT_NS_FOR_NEW_RESOURCE); + + conf.setUrisOnform(Arrays.asList("existingGrant")); + conf.setLiteralsOnForm(Arrays.asList("grantLabel", "grantLabelDisplay" )); + + conf.addSparqlForExistingLiteral("grantLabel", grantLabelQuery); + conf.addSparqlForExistingUris("existingGrant", existingGrantQuery); + + + conf.addField( new FieldVTwo(). // options will be added in browser by auto complete JS + setName("existingGrant") + ); + + conf.addField( new FieldVTwo(). + setName("grantLabel"). + setRangeDatatypeUri(XSD.xstring.toString() ). + setValidators( list("datatype:" + XSD.xstring.toString()) ) + ); + + conf.addField( new FieldVTwo(). + setName("grantLabelDisplay"). + setRangeDatatypeUri(XSD.xstring.toString() ). + setValidators( list("datatype:" + XSD.xstring.toString())) + ); + + conf.addValidator(new AntiXssValidation()); + conf.addValidator(new AutocompleteRequiredInputValidator("existingGrant", "grantLabel")); + +// addFormSpecificData(conf, vreq); + prepare(vreq, conf); + return conf; + } + + /* N3 assertions */ + + final static String n3ForNewAdminRole = + "@prefix vivo: <" + vivoCore + "> . \n\n" + + "?organization ?adminRole . \n" + + "?adminRole a vivo:AdministratorRole . \n" + + "?adminRole ?organization . " ; + + final static String n3ForNewAdminGrant = + "@prefix vivo: <" + vivoCore + "> . \n" + + "?adminRole vivo:relatedBy ?newGrant . \n" + + "?newGrant a vivo:Grant . \n" + + "?newGrant vivo:relates ?adminRole . \n" + + "?organization vivo:relatedBy ?newGrant . \n" + + "?newGrant vivo:relates ?organization . \n" + + "?newGrant <"+ label + "> ?grantLabel ."; + + final static String n3ForExistingAdminGrant = + "@prefix vivo: <" + vivoCore + "> . \n\n" + + "?adminRole vivo:relatedBy ?existingGrant . \n" + + "?existingGrant a . \n" + + "?existingGrant vivo:relates ?adminRole . \n" + + "?organization vivo:relatedBy ?newGrant . \n" + + "?newGrant vivo:relates ?organization . " ; + + /* Queries for editing an existing entry */ + + final static String existingGrantQuery = + "PREFIX vivo: \n" + + "SELECT ?existingGrant WHERE { \n" + + " ?adminRole vivo:relatedBy ?existingGrant . \n" + + " ?existingGrant a vivo:Grant . \n" + + "}"; + + final static String grantLabelQuery = + "PREFIX vivo: \n" + + "SELECT ?existingGrantLabel WHERE { \n" + + " ?adminRole vivo:relatedBy ?existingGrant . \n" + + " ?existingGrant a vivo:Grant . \n" + + " ?existingGrant <" + label + "> ?existingGrantLabel . \n" + + "}"; + +} diff --git a/themes/wilma/i18n/all.properties b/themes/wilma/i18n/all.properties index 3d43c23c..acca3b94 100644 --- a/themes/wilma/i18n/all.properties +++ b/themes/wilma/i18n/all.properties @@ -879,4 +879,6 @@ edit_publication_date = Edit publication date name_prefix = Name Prefix name_suffix = Name Suffix administering_organization_for = administering organization for -missing_credential = missing credential \ No newline at end of file +missing_credential = missing credential +grant_administered_by = grant being administered by +missing_grant = missing grant From 31d67162e944ea0ce6bb8c620e71d39c8a29d5c3 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: tworrall Date: Thu, 14 Nov 2013 09:36:13 -0500 Subject: [PATCH 03/46] VIVO-520: PropertyConfig additions to address missing properties --- .../display/everytime/PropertyConfig_es.n3 | 14 +- rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 | 146 +++++++++++++++++- 2 files changed, 156 insertions(+), 4 deletions(-) diff --git a/languages/example/rdf/display/everytime/PropertyConfig_es.n3 b/languages/example/rdf/display/everytime/PropertyConfig_es.n3 index 0aa366f3..a0737d96 100644 --- a/languages/example/rdf/display/everytime/PropertyConfig_es.n3 +++ b/languages/example/rdf/display/everytime/PropertyConfig_es.n3 @@ -43,4 +43,16 @@ "miembro de"@es . "tel\u00E9fono"@es . "tiene sub-organización"@es . - "organización dentro de"@es . \ No newline at end of file + "organización dentro de"@es . + + "administrado subvención por"@es . + "administra la subvención"@es . + "se produce dentro de evento"@es . + "contiene geográficamente"@es . + "geográficamente dentro de"@es . + "ubicación de los equipos"@es . + "ubicación geográfica de"@es . + "documentos relacionados"@es . + "tiene en la materia"@es . + "tiene sub-subvención"@es . + "sub-subvención de"@es . \ No newline at end of file diff --git a/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 b/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 index 11b83213..a2f8c7f4 100644 --- a/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 +++ b/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 @@ -896,7 +896,7 @@ local:eventWithinContext a :ConfigContext ; local:eventWithinConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; - :displayName "occurs within (parent event)" ; + :displayName "occurs within event" ; vitro:displayRankAnnot 1; vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; @@ -944,6 +944,20 @@ local:eventLocationConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; :propertyGroup . +local:eventRelatedDocsContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:eventRelatedDocsConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain ; + :qualifiedBy . + +local:eventRelatedDocsConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "related documents" ; + vitro:displayRankAnnot 2; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + local:organizationLocationContext a :ConfigContext ; :hasConfiguration local:organizationLocationConfig ; :configContextFor ; @@ -958,6 +972,20 @@ local:organizationLocationConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; :propertyGroup . +local:equipmentInFacilityContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:equipmentInFacilityConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain vivo:Equipment ; + :qualifiedBy vivo:Facility . + +local:equipmentInFacilityConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "in facility" ; + vitro:displayRankAnnot 2; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + local:hasRoomContext a :ConfigContext ; :hasConfiguration local:hasRoomConfig ; :configContextFor ; @@ -966,11 +994,67 @@ local:hasRoomContext a :ConfigContext ; local:hasRoomConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; - :displayName "has room" ; + :displayName "rooms" ; vitro:displayRankAnnot 2; vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; - :propertyGroup . + :propertyGroup . + +local:bldgGeographicallyContainsContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:bldgGeographicallyContainsConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain vivo:Building ; + :qualifiedBy vivo:GeographicLocation . + +local:bldgGeographicallyContainsConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "geographically contains" ; + vitro:displayRankAnnot 6; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + +local:bldgGeographicallyWithinContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:bldgGeographicallyWithinConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain vivo:Building ; + :qualifiedBy vivo:GeographicLocation . + +local:bldgGeographicallyWithinConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "geographically within" ; + vitro:displayRankAnnot 10; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + +local:bldgEquipmentLocationContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:bldgEquipmentLocationConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain vivo:Facility ; + :qualifiedBy vivo:Equipment . + +local:bldgEquipmentLocationConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "location of equipment" ; + vitro:displayRankAnnot 14; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + +local:bldgGeographicLocationOfContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:bldgGeographicLocationOfConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain vivo:Facility ; + :qualifiedBy vivo:GeographicLocation . + +local:bldgGeographicLocationOfConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "geographic location of" ; + vitro:displayRankAnnot 18; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . local:courseOfferedByContext a :ConfigContext ; :hasConfiguration local:courseOfferedByConfig ; @@ -1071,6 +1155,62 @@ local:grantAwardedByConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; :propertyGroup . +local:grantSubjectAreaContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:grantSubjectAreaConfig ; + :configContextFor vivo:hasSubjectArea ; + :qualifiedByDomain vivo:Grant ; + :qualifiedBy . + +local:grantSubjectAreaConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "has subject area" ; + vitro:displayRankAnnot 10; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + +local:grantHasSubgrantContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:grantHasSubgrantConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain vivo:Grant ; + :qualifiedBy vivo:Grant . + +local:grantHasSubgrantConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "has sub grant" ; + vitro:displayRankAnnot 20; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + +local:grantIsSubgrantOfContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:grantIsSubgrantOfConfig ; + :configContextFor ; + :qualifiedByDomain vivo:Grant ; + :qualifiedBy vivo:Grant . + +local:grantIsSubgrantOfConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "sub grant of" ; + vitro:displayRankAnnot 20; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + +local:grantGeographicFocusContext a :ConfigContext ; + :hasConfiguration local:grantGeographicFocusConfig ; + :configContextFor vivo:geographicFocus ; + :qualifiedByDomain vivo:Grant ; + :qualifiedBy vivo:GeographicRegion . + +local:grantGeographicFocusConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; + :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ; + :displayName "geographic focus" ; + vitro:displayRankAnnot 20; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + :propertyGroup . + local:awardOrHonorReceiptsContext a :ConfigContext ; :hasConfiguration local:awardOrHonorReceiptsConfig ; :configContextFor ; From 15c59932ddd809e23b68c49a218366064a98b779 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: brianjlowe Date: Thu, 14 Nov 2013 09:52:11 -0500 Subject: [PATCH 04/46] VIVO-435 changed domain/range of cites/citedBy and removed odd individuals that came in with the ISF --- rdf/tbox/filegraph/object-properties.owl | 8 +- rdf/tbox/filegraph/research-resource-iao.owl | 91 -------------------- rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 | 57 ------------ 3 files changed, 4 insertions(+), 152 deletions(-) diff --git a/rdf/tbox/filegraph/object-properties.owl b/rdf/tbox/filegraph/object-properties.owl index f61d226f..9f352dd2 100644 --- a/rdf/tbox/filegraph/object-properties.owl +++ b/rdf/tbox/filegraph/object-properties.owl @@ -1141,8 +1141,8 @@ there is a measurement process p that has specified output m, a measurement datu - - + + @@ -1150,8 +1150,8 @@ there is a measurement process p that has specified output m, a measurement datu - - + + diff --git a/rdf/tbox/filegraph/research-resource-iao.owl b/rdf/tbox/filegraph/research-resource-iao.owl index f547f619..fd99cd3b 100644 --- a/rdf/tbox/filegraph/research-resource-iao.owl +++ b/rdf/tbox/filegraph/research-resource-iao.owl @@ -240,36 +240,6 @@ this case we explicitly refer to the singular form - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Better to represent curation as a process with parts and then relate labels to that process (in IAO meeting) - GROUP:OBI:<http://purl.obolibrary.org/obo/obi> - OBI_0000266 - PERSON:Bill Bug - The curation status of the term. The allowed values come from an enumerated list of predefined terms. See the specification of these instances for more detailed definitions of each enumerated value. - curation status specification - - - - @@ -335,31 +305,6 @@ this case we explicitly refer to the singular form - - - - - - - - - - - - - - - - - PERSON: Alan Ruttenberg - PERSON: Melanie Courtot - The creation of this class has been inspired in part by Werner Ceusters' paper, Applying evolutionary terminology auditing to the Gene Ontology. - The reason for which a term has been deprecated. The allowed values come from an enumerated list of predefined terms. See the specification of these instances for more detailed definitions of each enumerated value. - obsolescence reason specification - - - - @@ -377,27 +322,6 @@ this case we explicitly refer to the singular form - - - - - - - - - - - - - - - A denotator type indicates how a term should be interpreted from an ontological perspective. - Alan Ruttenberg - Barry Smith, Werner Ceusters - The Basic Formal Ontology ontology makes a distinction between Universals and defined classes, where the formal are "natural kinds" and the latter arbitrary collections of entities. - - - @@ -421,21 +345,6 @@ this case we explicitly refer to the singular form - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 b/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 index 079ab8c4..70ca6ef5 100644 --- a/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 +++ b/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 @@ -275,9 +275,6 @@ vivo:Licensure vivo:inPress rdfs:label "in press"@en-US . -obo:IAO_0000078 - rdfs:label "Curation Status Specification"@en-US . - vivo:placeOfPublication rdfs:label "place of publication"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -293,9 +290,6 @@ vivo:placeOfPublication vitro:publicDescriptionAnnot "City in which the publication was done."^^xsd:string . -obo:IAO_0000125 - rdfs:label "pending final vetting"@en-US . - vivo:hasCollaborator rdfs:label "collaborator"@en-US ; vitro:customEntryFormAnnot @@ -502,9 +496,6 @@ owl:sameAs vitro:stubObjectPropertyAnnot "true"^^xsd:boolean . -obo:IAO_0000123 - rdfs:label "metadata incomplete"@en-US . - vcard:hasTimeZone rdfs:label "has time zone"@en-US . @@ -560,9 +551,6 @@ geo:territory vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot . -obo:IAO_0000122 - rdfs:label "ready for release"@en-US . - vcard:OrganizationName rdfs:label "Organization Name"@en-US . @@ -722,9 +710,6 @@ bibo:Issue vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot . -obo:IAO_0000121 - rdfs:label "organizational term"@en-US . - vcard:uid rdfs:label "uid"@en-US . @@ -816,9 +801,6 @@ geo:codeFAOSTAT vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean . -obo:IAO_0000120 - rdfs:label "metadata complete"@en-US . - vivo:AttendeeRole rdfs:label "Attendee Role"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -1754,9 +1736,6 @@ geo:nameCurrencyFR obo:BFO_0000017 rdfs:label "Realizable Entity"@en-US . -obo:IAO_0000410 - rdfs:label "universal"@en-US . - vivo:hasGoverningAuthority rdfs:label "governing authority"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -2009,9 +1988,6 @@ vcard:note obo:ERO_0000779 rdfs:label "Permanent Resident Role"@en-US . -obo:IAO_0000226 - rdfs:label "placeholder removed"@en-US . - bibo:issue rdfs:label "issue"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -2267,9 +2243,6 @@ vivo:description vitro:publicDescriptionAnnot "An account of the resource."^^xsd:string . -obo:IAO_0000224 - rdfs:label "core"@en-US . - geo:hasCode rdfs:label "has code"@en-US ; vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot @@ -2401,9 +2374,6 @@ vivo:hasSubjectArea obo:ARG_2000083 rdfs:label "American Board of Plastic Surgery"@en-US . -obo:IAO_0000225 - rdfs:label "Obsolescence Reason Specification"@en-US . - obo:ERO_0000398 rdfs:label "is performed by"@en-US . @@ -2715,9 +2685,6 @@ vivo:ClinicalOrganization vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot . -obo:IAO_0000229 - rdfs:label "term split"@en-US . - vivo:Program rdfs:label "Program"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -2831,9 +2798,6 @@ obo:ERO_0000777 obo:ARG_2000067 rdfs:label "American Board of Colon and Rectal Surgery"@en-US . -obo:IAO_0000228 - rdfs:label "term imported"@en-US . - bibo:Thesis rdfs:label "Thesis"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -4430,9 +4394,6 @@ vivo:FacultyMember vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot . -obo:IAO_0000428 - rdfs:label "requires discussion"@en-US . - vivo:hideFromDisplay rdfs:label "hide from display"@en-US ; vitro:displayRankAnnot @@ -4598,9 +4559,6 @@ vivo:Internship obo:ARG_2000379 rdfs:label "Contact"@en-US . -obo:IAO_0000409 - rdfs:label "Denotator Type"@en-US . - vcard:RelatedType rdfs:label "Relation Type"@en-US . @@ -4807,9 +4765,6 @@ vivo:InvestigatorRole vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot . -obo:IAO_0000423 - rdfs:label "to be replaced with external ontology term"@en-US . - bibo:BookSection rdfs:label "Book Section"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -5563,9 +5518,6 @@ geo:special_group vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot . -obo:IAO_0000420 - rdfs:label "Defined Class"@en-US . - geo:countryAreaUnit rdfs:label "country area unit"@en-US ; vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot @@ -5789,9 +5741,6 @@ bibo:eanucc13 vitro:publicDescriptionAnnot "EAN International-Uniform Code Council (EAN-UCC) was a supply chain standards family name, formally the EAN.UCC System, that included product barcodes which are printed on the great majority of products available in stores worldwide and electronic commerce standards."^^xsd:string . -obo:IAO_0000421 - rdfs:label "Named Class Expression"@en-US . - bibo:EditedBook rdfs:label "Edited Book"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot @@ -6576,9 +6525,6 @@ vivo:dateTimeInterval vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean . -obo:IAO_0000103 - rdfs:label "Failed Exploratory Term"@en-US . - vcard:formattedName rdfs:label "has formatted name"@en-US . @@ -6613,9 +6559,6 @@ obo:ARG_2000076 obo:BFO_0000034 rdfs:label "Function"@en-US . -obo:IAO_0000002 - rdfs:label "example to be eventually removed"@en-US . - vivo:EmeritusProfessor rdfs:label "Professor Emeritus"@en-US ; vitro:displayLimitAnnot From bcf395732e0b62d5418f631944d3f9028d9b73a4 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: brianjlowe Date: Thu, 14 Nov 2013 10:38:51 -0500 Subject: [PATCH 05/46] VIVO-527 VIVO-526 VIVO-528 property visibility and annotations --- rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 | 2 ++ rdf/tbox/filegraph/appControls-temp.n3 | 6 ++++ rdf/tbox/filegraph/object-properties3.owl | 21 +++++++++++-- rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 | 31 ++++++++++++++++++++ 4 files changed, 58 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 b/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 index a2f8c7f4..3ff50cfd 100644 --- a/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 +++ b/rdf/display/everytime/PropertyConfig.n3 @@ -1153,6 +1153,7 @@ local:grantAwardedByConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; vitro:displayRankAnnot 2; vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ; :propertyGroup . local:grantSubjectAreaContext a :ConfigContext ; @@ -1279,6 +1280,7 @@ local:orgAwardsGrantConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ; vitro:displayRankAnnot 61; vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ; vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ; + vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ; :propertyGroup . local:addressLocationContext a :ConfigContext ; diff --git a/rdf/tbox/filegraph/appControls-temp.n3 b/rdf/tbox/filegraph/appControls-temp.n3 index 94b09b6b..b66095d2 100644 --- a/rdf/tbox/filegraph/appControls-temp.n3 +++ b/rdf/tbox/filegraph/appControls-temp.n3 @@ -53,6 +53,12 @@ foaf:Agent owl:onProperty core:relatedBy ] . +vivo:Equipment + rdfs:subClassOf + [ a owl:Restriction ; + owl:onProperty ; + owl:allValuesFrom + ] . foaf:Person rdfs:subClassOf diff --git a/rdf/tbox/filegraph/object-properties3.owl b/rdf/tbox/filegraph/object-properties3.owl index f4ea1be4..793b44c5 100644 --- a/rdf/tbox/filegraph/object-properties3.owl +++ b/rdf/tbox/filegraph/object-properties3.owl @@ -349,7 +349,16 @@ - + + + + + + + + + + @@ -400,7 +409,15 @@ - + + + + + equipment for + + + + diff --git a/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 b/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 index 70ca6ef5..41ecfe3a 100644 --- a/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 +++ b/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations.n3 @@ -2033,6 +2033,10 @@ bibo:number obo:RO_0001025 rdfs:label "located in"@en-US ; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot + ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot + ; vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean . @@ -7265,3 +7269,30 @@ geo:validSince geo:validUntil vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot . + + + vivo:equipmentFor + rdfs:label "equipment for"@en-US ; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot + ; + vitro:inPropertyGroupAnnot + ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot + ; + vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ; + vitro:selectFromExistingAnnot + "true"^^xsd:boolean . + +vivo:hasEquipment + vitro:displayRankAnnot + "80"^^xsd:int ; + vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot + ; + vitro:inPropertyGroupAnnot + ; + vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot + ; + vitro:selectFromExistingAnnot + "true"^^xsd:boolean ; + vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ; + rdfs:label "has equipment"@en-US . From 805491e52f309c08a4562e2c84261b4767ecbff5 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: j2blake Date: Thu, 14 Nov 2013 11:14:32 -0500 Subject: [PATCH 06/46] =?UTF-8?q?In=20the=20build,=20apply=20=E2=80=9Cskip?= =?UTF-8?q?info=E2=80=9D=20consistently.?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- build.xml | 2 +- 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-) diff --git a/build.xml b/build.xml index c19a9b9a..28055179 100644 --- a/build.xml +++ b/build.xml @@ -101,7 +101,7 @@ Override the core version, to get the 2-level effect. ================================= --> - + From be3f22bca657826bf82cb50d64b2157ad10c6665 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: j2blake Date: Thu, 14 Nov 2013 17:04:22 -0500 Subject: [PATCH 07/46] VIVO-523 Change the way the example language files are presented. --- config/example.runtime.properties | 2 +- .../firsttime/classgroups_labels_es_GO.n3} | 16 +- .../firsttime/propertygroups_labels_es_GO.n3} | 32 +- .../everytime/PropertyConfig_es_GO.n3} | 114 +- .../rdf/display/firsttime/aboutPage_es_GO.n3} | 2 +- .../rdf/display/firsttime/menu_es_GO.n3} | 34 +- .../initialTBoxAnnotations_es_GO.n3} | 1806 ++++++++--------- .../freemarker/aboutMapOfScience_es_GO.ftl} | 0 .../freemarker/aboutQrCodes_es_GO.ftl} | 0 .../mapOfScienceTooltips_es_GO.ftl} | 0 .../themes/wilma/i18n/all_es_GO.properties} | 0 .../wilma/i18n/images/select_locale_es_GO.png | Bin 0 -> 6134 bytes .../wilma/i18n/images/select_locale_es_ES.GIF | Bin 1186 -> 0 bytes 13 files changed, 1003 insertions(+), 1003 deletions(-) rename languages/{example/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es.n3 => es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es_GO.n3} (52%) rename languages/{example/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es.n3 => es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es_GO.n3} (62%) rename languages/{example/rdf/display/everytime/PropertyConfig_es.n3 => es_GO/rdf/display/everytime/PropertyConfig_es_GO.n3} (77%) rename languages/{example/rdf/display/firsttime/aboutPage_es.n3 => es_GO/rdf/display/firsttime/aboutPage_es_GO.n3} (98%) rename languages/{example/rdf/display/firsttime/menu_es.n3 => es_GO/rdf/display/firsttime/menu_es_GO.n3} (54%) rename languages/{example/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations_es.n3 => es_GO/rdf/tbox/firsttime/initialTBoxAnnotations_es_GO.n3} (63%) rename languages/{example/templates/freemarker/aboutMapOfScience_es.ftl => es_GO/templates/freemarker/aboutMapOfScience_es_GO.ftl} (100%) rename languages/{example/templates/freemarker/aboutQrCodes_es.ftl => es_GO/templates/freemarker/aboutQrCodes_es_GO.ftl} (100%) rename languages/{example/templates/freemarker/mapOfScienceTooltips_es.ftl => es_GO/templates/freemarker/mapOfScienceTooltips_es_GO.ftl} (100%) rename languages/{example/themes/wilma/i18n/all_es.properties => es_GO/themes/wilma/i18n/all_es_GO.properties} (100%) create mode 100644 languages/es_GO/themes/wilma/i18n/images/select_locale_es_GO.png delete mode 100644 languages/example/themes/wilma/i18n/images/select_locale_es_ES.GIF diff --git a/config/example.runtime.properties b/config/example.runtime.properties index 7c528649..f6fce759 100644 --- a/config/example.runtime.properties +++ b/config/example.runtime.properties @@ -181,7 +181,7 @@ RDFService.languageFilter = true # # This should not be used with languages.forceLocale, which will override it. # -# languages.selectableLocales = en_US, es_ES +# languages.selectableLocales = en_US, es_GO # # Tell VIVO to generate HTTP headers on its responses to facilitate caching the diff --git a/languages/example/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es.n3 b/languages/es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es_GO.n3 similarity index 52% rename from languages/example/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es.n3 rename to languages/es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es_GO.n3 index 48806d99..9ce6f094 100644 --- a/languages/example/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es.n3 +++ b/languages/es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/classgroups_labels_es_GO.n3 @@ -1,8 +1,8 @@ - "personas"@es . - "investigaci\u00F3n"@es . - "organizaciones"@es . - "actividades"@es . - "cursos"@es . - "eventos"@es . - "equipo"@es . - "ubicaciones"@es . + "personas"@es-GO . + "investigaci\u00F3n"@es-GO . + "organizaciones"@es-GO . + "actividades"@es-GO . + "cursos"@es-GO . + "eventos"@es-GO . + "equipo"@es-GO . + "ubicaciones"@es-GO . diff --git a/languages/example/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es.n3 b/languages/es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es_GO.n3 similarity index 62% rename from languages/example/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es.n3 rename to languages/es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es_GO.n3 index 8201ff14..8c2ed412 100644 --- a/languages/example/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es.n3 +++ b/languages/es_GO/rdf/applicationMetadata/firsttime/propertygroups_labels_es_GO.n3 @@ -1,16 +1,16 @@ - "identidad"@es . - "documentos relacionados"@es . - 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VIVO es una aplicación web semántica código abierto originalmente desarrollado e implementado en Cornell. Cuando se instala y se rellena con el contenido en una institución, que permite el descubrimiento de la investigación y de becas en todas las disciplinas de esta institución. VIVO compatible con la navegación y una función de búsqueda que devuelve resultados facetas para una rápida recuperación de la información deseada. Contenido en cualquier instalación VIVO local puede mantenerse manualmente o puesto en la base de datos de forma automática de los sistemas locales de registro, tales como recursos humanos, becas, cursos, y bases de datos de la actividad docente.

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  • " + + academicDepartments[index].name + "
    • "; + //add this index to the set of already used indices + indicesUsed[index] = true; + //keep count + indicesCount++; + } } } else { diff --git a/productMods/templates/freemarker/lib/lib-home-page.ftl b/productMods/templates/freemarker/lib/lib-home-page.ftl index 7235a394..21596902 100644 --- a/productMods/templates/freemarker/lib/lib-home-page.ftl +++ b/productMods/templates/freemarker/lib/lib-home-page.ftl @@ -125,7 +125,7 @@ <#if (group.individualCount > 0) && group.displayName == "research" > <#assign foundClassGroup = true /> <#list group.classes as class> - <#if (class.individualCount > 0) && (class.uri?contains("Academic Article") || class.uri?contains("Book") || class.uri?contains("Chapter") ||class.uri?contains("Conference Paper") || class.uri?contains("Proceedings") || class.uri?contains("Report")) > + <#if (class.individualCount > 0) && (class.uri?contains("AcademicArticle") || class.uri?contains("Book") || class.uri?contains("Chapter") ||class.uri?contains("ConferencePaper") || class.uri?contains("Proceedings") || class.uri?contains("Report")) >
  • ${class.individualCount!}  From 64685d84b66f66696ce0407cf76db10e3d0ab6d0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: j2blake Date: Sun, 17 Nov 2013 11:50:26 -0500 Subject: [PATCH 09/46] VIVO-541 First cut at the developer panel. --- config/example.runtime.properties | 33 +-------------- doc/install.html | 59 -------------------------- doc/upgrade-1.6.html | 69 +++++-------------------------- productMods/WEB-INF/web.xml | 9 ++++ themes/wilma/templates/menu.ftl | 2 + 5 files changed, 22 insertions(+), 150 deletions(-) diff --git a/config/example.runtime.properties b/config/example.runtime.properties index f6fce759..587ffb4c 100644 --- a/config/example.runtime.properties +++ b/config/example.runtime.properties @@ -196,41 +196,10 @@ RDFService.languageFilter = true # # http.createCacheHeaders = true -# -# For developers only: Setting this option to "true" slows down VIVO performance. -# -# Defeat the Freemarker template cache, so each template is read from disk -# on each request. This permits developers to immediately see the effect of -# changes to the template. The default is false, which means -# that a cached copy of each template will be used for 60 seconds before -# the disk is checked for a new version. -# -# developer.defeatFreemarkerCache = true - -# -# For developers only: Setting this option to "true" slows down VIVO performance. -# -# Defeat the cache of language-specific text strings, so the language file -# is read from disk on each request. This permits developers to immediately -# see the effect of changes to the text strings. The default is -# false, which means that the language file is read when -# VIVO starts up, or when a new theme is selected. -# -# developer.defeatI18nCache = true - -# -# For developers only: Setting this option to "true" slows down VIVO performance. -# -# Add starting and ending delimiters to each Freemarker template, so you can see -# which template were invoked by viewing the generated HTML. The default is -# false. -# -# developer.insertFreemarkerDelimiters = true - # # For OpenSocial integration # The base URL of the ORNG Shindig server. Usually, this is the same host and port -# number as VIVO iteself, with a context path of "shindigorng". +# number as VIVO itself, with a context path of "shindigorng". # #OpenSocial.shindigURL = http://localhost:8080/shindigorng diff --git a/doc/install.html b/doc/install.html index c30b768e..81f71145 100644 --- a/doc/install.html +++ b/doc/install.html @@ -863,65 +863,6 @@ issuing SPARQL queries that read data, and its URI for issuing SPARQL UPDATE com - - - For developers only. - Defeat the Freemarker template cache, so each template - is read from disk on each request. This permits developers to immediately - see the effect of changes to the template. The default is false, which - means that a cached copy of each template will be used for 60 seconds - before the disk is checked for a new version. -
    Setting this option to "true" slows down VIVO performance. - - - - - developer.defeatFreemarkerCache - - - false - - - - - - For developers only. - Defeat the cache of language-specific text strings, - so the language file is read from disk on each request. - This permits developers to immediately - see the effect of changes to the text strings. - The default is false, which means that the language file is - read when VIVO starts up, or when a new theme is selected. -
    Setting this option to "true" slows down VIVO performance. - - - - - developer.defeatI18nCache = true - - - false - - - - - - For developers only. - Add starting and ending delimiters to each Freemarker template, so you can see - which template were invoked by viewing the generated HTML. - The default is false. -
    Setting this option to "true" slows down VIVO performance. - - - - - developer.insertFreemarkerDelimiters = true - - - false - - - On the VIVO home page, display a global map highlighting the geographical focus diff --git a/doc/upgrade-1.6.html b/doc/upgrade-1.6.html index 0cb35e51..349cb3a0 100644 --- a/doc/upgrade-1.6.html +++ b/doc/upgrade-1.6.html @@ -52,6 +52,7 @@
  • Support for additional languages
  • More compact responses to Linked data requests
  • Changes to default types for Google Refine
    • +
  • Special runtime settings for developers
  • Upgrade Instructions
    • @@ -423,6 +424,15 @@

    +
  • +

    Special runtime settings for developers

    +

    + This release includes several settings to help developers by instumenting the + freemarker templates and the SPARQL queries on the RDFService. Check the wiki for + details, or look in the home directory in example.developer.properties. +

    +
    • +

  • Supported Browsers

    @@ -613,65 +623,6 @@ - - - For developers only. - Defeat the Freemarker template cache, so each template - is read from disk on each request. This permits developers to immediately - see the effect of changes to the template. The default is false, which - means that a cached copy of each template will be used for 60 seconds - before the disk is checked for a new version. -
    Setting this option to "true" slows down VIVO performance. - - - - - developer.defeatFreemarkerCache - - - false - - - - - - For developers only. - Defeat the cache of language-specific text strings, - so the language file is read from disk on each request. - This permits developers to immediately - see the effect of changes to the text strings. - The default is false, which means that the language file is - read when VIVO starts up, or when a new theme is selected. -
    Setting this option to "true" slows down VIVO performance. - - - - - developer.defeatI18nCache - - - false - - - - - - For developers only. - Add starting and ending delimiters to each Freemarker template, so you can see - which template were invoked by viewing the generated HTML. - The default is false. -
    Setting this option to "true" slows down VIVO performance. - - - - - developer.insertFreemarkerDelimiters - - - false - - - On the VIVO home page, display a global map highlighting the geographical focus diff --git a/productMods/WEB-INF/web.xml b/productMods/WEB-INF/web.xml index 8fc98681..c4877446 100644 --- a/productMods/WEB-INF/web.xml +++ b/productMods/WEB-INF/web.xml @@ -853,6 +853,15 @@ /searchHelp + + DeveloperAjax + edu.cornell.mannlib.vitro.webapp.utils.developer.DeveloperSettingsServlet + + + DeveloperAjax + /admin/developerAjax + + SearchController diff --git a/themes/wilma/templates/menu.ftl b/themes/wilma/templates/menu.ftl index 71da4e1f..a3476b82 100644 --- a/themes/wilma/templates/menu.ftl +++ b/themes/wilma/templates/menu.ftl @@ -2,6 +2,8 @@ +<#include "developer.ftl"> +