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19
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/AdviseeRole.sparql
View file

@ -1,19 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?advisee <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:AdviseeRole .
_:AdviseeRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?advisee .
_:AdviseeRole a vivo:AdviseeRole .
_:AdviseeRole vivo:relatedBy ?advisingRelationship .
?advisingRelationship vivo:relates _:AdviseeRole .
?advisingRelationship vivo:relates ?advisee .
?advisee vivo:relatedBy ?advisingRelationship .
} WHERE {
?advisee vivo:adviseeIn ?advisingRelationship .
FILTER NOT EXISTS {
?advisee <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?adviseeRoleNode .
?adviseeRoleNode vivo:relatedBy ?advisingRelationship .
}
}

19
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/AdvisorRole.sparql
View file

@ -1,19 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?advisor <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:AdvisorRole .
_:AdvisorRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?advisor .
_:AdvisorRole a vivo:AdvisorRole .
_:AdvisorRole vivo:relatedBy ?advisingRelationship .
?advisingRelationship vivo:relates _:AdvisorRole .
?advisingRelationship vivo:relates ?advisor .
?advisor vivo:relatedBy ?advisingRelationship .
} WHERE {
?advisor vivo:advisorIn ?advisingRelationship .
FILTER NOT EXISTS {
?advisor <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?advisorRoleNode .
?advisorRoleNode vivo:relatedBy ?advisingRelationship .
}
}

22
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/Editorship.sparql
View file

@ -1,22 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?person vivo:relatedBy _:Editorship .
_:Editorship a vivo:Editorship .
_:Editorship vivo:relates ?person .
_:Editorship vivo:relates ?document .
?document vivo:relatedBy _:Editorship .
} WHERE {
{
?person vivo:editorOf ?document
} UNION {
?document vivo:editor ?person
FILTER NOT EXISTS { ?person vivo:editorOf ?document }
}
FILTER NOT EXISTS {
?person vivo:relatedBy ?editorshipNode .
?editorshipNode vivo:relates ?document .
}
}

21
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/LeaderRole.sparql
View file

@ -1,21 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:leaderRole .
_:leaderRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?person .
_:leaderRole a vivo:LeaderRole .
_:leaderRole vivo:roleContributesTo ?org .
?org vivo:contributingRole _:leaderRole .
} WHERE {
{ ?person vivo:currentlyHeadOf ?org }
UNION
{ ?org vivo:currentlyHeadedBy ?person
FILTER NOT EXISTS { ?person vivo:currentlyHeadOf ?org }
}
FILTER NOT EXISTS {
?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?leaderRoleNode .
?leaderRoleNode vivo:roleContributesTo ?org .
}
}

21
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/MemberRole.sparql
View file

@ -1,21 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:memberRole .
_:memberRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?person .
_:memberRole a vivo:MemberRole .
_:memberRole vivo:roleContributesTo ?org .
?org vivo:contributingRole _:memberRole .
} WHERE {
{ ?person vivo:currentMemberOf ?org }
UNION
{ ?org vivo:hasCurrentMember ?person
FILTER NOT EXISTS { ?person vivo:currentMemberOf ?org }
}
FILTER NOT EXISTS {
?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?memberRoleNode .
?memberRoleNode vivo:roleContributesTo ?org .
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/concept.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX skos: <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#>
CONSTRUCT {
?concept a skos:Concept .
} WHERE {
{ ?s vivo:hasResearchArea ?concept } UNION
{ ?s vivo:hasSubjectArea ?concept }
FILTER NOT EXISTS {
?concept a skos:Concept
}
}

11
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/grant-pre.sparql
View file

@ -1,11 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?role vivo:relatedBy ?grant .
?grant vivo:relates ?role
} WHERE {
?role vivo:roleContributesTo ?grant .
{ ?grant a vivo:Grant } UNION { ?grant a vivo:Contract }
}

24
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/grantAdmin.sparql
View file

@ -1,24 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?agent <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> _:adminRole .
_:adminRole a vivo:AdministratorRole .
_:adminRole <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000052> ?agent .
_:adminRole vivo:relatedBy ?grant .
?grant vivo:relates _:adminRole .
?grant vivo:relates ?agent .
?agent vivo:relatedBy ?grant .
} WHERE {
{ ?agent vivo:administers ?grant }
UNION
{ ?grant vivo:administeredBy ?agent
FILTER NOT EXISTS { ?agent vivo:administers ?grant }
}
FILTER NOT EXISTS {
?agent <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?adminRoleNode .
?adminRoleNode a vivo:AdministratorRole .
?adminRoleNode vivo:relatedBy ?grant .
}
}

12
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/orcid.sparql
View file

@ -1,12 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
CONSTRUCT {
?s vivo:orcidId ?orcidURI .
?orcidURI a owl:Thing .
} WHERE {
?s vivo:orcidId ?orcidString
FILTER(isLiteral(?orcidString))
FILTER (regex(str(?orcidString), "^[0-9][0-9][0-9][0-9]-[0-9][0-9][0-9][0-9]-[0-9][0-9][0-9][0-9]-[0-9][0-9][0-9]([0-9]|X)$"))
BIND(IRI(concat("http://orcid.org/", str(?orcidString))) AS ?orcidURI)
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/post/Grant.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?agent vivo:relatedBy ?grant .
?grant vivo:relates ?agent
} WHERE {
?agent <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?role .
?role vivo:relatedBy ?grant .
{ ?grant a vivo:Grant } UNION { ?grant a vivo:Contract }
FILTER NOT EXISTS { ?grant vivo:relates ?agent }
}

14
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/post/awardConferred.sparql
View file

@ -1,14 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?awardReceipt vivo:assignedBy ?org .
?org vivo:assigns ?awardReceipt .
} WHERE {
?org vivo:assigns ?award .
?award a vivo:Award .
?org a foaf:Organization .
?awardReceipt vivo:relates ?award .
?awardReceipt a vivo:AwardReceipt .
}

29
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/post/awardedDegree.sparql
View file

@ -1,29 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002234> _:awardedDegree .
_:awardedDegree <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002353> ?educationalProcess .
_:awardedDegree a vivo:AwardedDegree .
_:awardedDegree vivo:relates ?degree .
?degree vivo:relatedBy _:awardedDegree .
_:awardedDegree vivo:relates ?person .
?person vivo:relatedBy _:awardedDegree .
_:awardedDegree vivo:assignedBy ?org .
?org vivo:assigns _:awardedDegree .
} WHERE {
?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000056> ?educationalProcess .
?person a foaf:Person .
?educationalProcess a vivo:EducationalProcess .
?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002234> ?degree .
?degree a vivo:AcademicDegree .
OPTIONAL {
?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000057> ?org .
?org a foaf:Organization
}
FILTER NOT EXISTS {
?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002234> ?awardedDegreeNode .
?person vivo:relatedBy ?awardedDegreeNode .
}
}

15
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/post/contributingAdvising.sparql
View file

@ -1,15 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000055> ?role .
?role <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000054> ?educationalProcess .
} WHERE {
?educationalProcess vivo:contributingAdvising ?advising .
?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000056> ?educationalProcess .
?person a foaf:Person .
?educationalProcess a vivo:EducationalProcess .
?advising vivo:relates ?role .
?role a <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000023> .
}

29
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard1-0.sparql
View file

@ -1,29 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?s arg:ARG_2000028 _:vcard .
_:vcard arg:ARG_2000029 ?s .
_:vcard a v:Individual .
} WHERE {
?s a foaf:Person
FILTER (
EXISTS { ?s foaf:firstName ?firstName } ||
EXISTS { ?s foaf:lastName ?lastName } ||
EXISTS { ?s vivo:middleName ?middleName } ||
EXISTS { ?s vivo:email ?email } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail } ||
EXISTS { ?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryPhoneNumber ?primaryPhoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:faxNumber ?faxNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:mailingAddress ?address } ||
EXISTS { ?s vivo:webpage ?webpage } ||
EXISTS { ?s vivo:preferredTitle ?preferredTitle } ||
EXISTS { ?s bibo:prefixName ?prefixName } ||
EXISTS { ?s bibo:suffixName ?suffixName }
)
FILTER NOT EXISTS { ?s arg:ARG_2000028 ?vcardNode }
}

22
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard1-1.sparql
View file

@ -1,22 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?s arg:ARG_2000028 _:vcard .
_:vcard arg:ARG_2000029 ?s .
_:vcard a v:Organization .
} WHERE {
?s a foaf:Organization
FILTER (
EXISTS { ?s vivo:email ?email } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail } ||
EXISTS { ?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryPhoneNumber ?primaryPhoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:faxNumber ?faxNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:mailingAddress ?address } ||
EXISTS { ?s vivo:webpage ?webpage }
)
FILTER NOT EXISTS { ?s arg:ARG_2000028 ?vcardNode }
}

22
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard1-2.sparql
View file

@ -1,22 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?s arg:ARG_2000028 _:vcard .
_:vcard arg:ARG_2000029 ?s .
_:vcard a v:Group .
} WHERE {
?s a foaf:Group
FILTER (
EXISTS { ?s vivo:email ?email } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail } ||
EXISTS { ?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryPhoneNumber ?primaryPhoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:faxNumber ?faxNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:mailingAddress ?address } ||
EXISTS { ?s vivo:webpage ?webpage }
)
FILTER NOT EXISTS { ?s arg:ARG_2000028 ?vcardNode }
}

23
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard1-3.sparql
View file

@ -1,23 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
CONSTRUCT {
?s arg:ARG_2000028 _:vcard .
_:vcard arg:ARG_2000029 ?s .
_:vcard a v:Kind .
} WHERE {
?s a owl:Thing
FILTER (
EXISTS { ?s vivo:email ?email } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail } ||
EXISTS { ?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:primaryPhoneNumber ?primaryPhoneNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:faxNumber ?faxNumber } ||
EXISTS { ?s vivo:mailingAddress ?address } ||
EXISTS { ?s vivo:webpage ?webpage }
)
FILTER NOT EXISTS { ?s arg:ARG_2000028 ?vcardNode }
}

17
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard22.sparql
View file

@ -1,17 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasTitle _:title .
_:title a v:Title .
_:title v:title ?preferredTitle .
} WHERE {
?s <http://vivoweb.org/ontology/core#preferredTitle> ?preferredTitle .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasTitle ?title
}
}

17
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2a.sparql
View file

@ -1,17 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasName _:name .
_:name a v:Name .
_:name v:givenName ?firstName .
} WHERE {
?s foaf:firstName ?firstName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasName ?name
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2b.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?name v:givenName ?firstName .
} WHERE {
?s foaf:firstName ?firstName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
?vcard v:hasName ?name
}

17
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2c.sparql
View file

@ -1,17 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasName _:name .
_:name a v:Name .
_:name vivo:middleName ?middleName .
} WHERE {
?s vivo:middleName ?middleName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasName ?name
}
}

14
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2d.sparql
View file

@ -1,14 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?name vivo:middleName ?middleName .
} WHERE {
?s vivo:middleName ?middleName .
?s a foaf:Person .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
?vcard v:hasName ?name
}

17
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2e.sparql
View file

@ -1,17 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasName _:name .
_:name a v:Name .
_:name v:familyName ?lastName .
} WHERE {
?s foaf:lastName ?lastName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasName ?name
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2f.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?name v:familyName ?lastName .
} WHERE {
?s foaf:lastName ?lastName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
?vcard v:hasName ?name
}

17
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2g.sparql
View file

@ -1,17 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
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PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasName _:name .
_:name a v:Name .
_:name v:honorificPrefix ?prefixName .
} WHERE {
?s bibo:prefixName ?prefixName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasName ?name
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2h.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?name v:honorificPrefix ?prefixName .
} WHERE {
?s bibo:prefixName ?prefixName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
?vcard v:hasName ?name
}

17
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2i.sparql
View file

@ -1,17 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasName _:name .
_:name a v:Name .
_:name v:honorificSuffix ?suffixName .
} WHERE {
?s bibo:suffixName ?suffixName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasName ?name
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2j.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?name v:honorificSuffix ?suffixName .
} WHERE {
?s bibo:suffixName ?suffixName .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
?vcard v:hasName ?name
}

16
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard3.sparql
View file

@ -1,16 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasEmail _:email .
_:email a v:Email .
_:email v:email ?email .
} WHERE {
?s vivo:email ?email .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasEmail ?emailnode
}
}

18
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard4.sparql
View file

@ -1,18 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasEmail _:primaryEmail .
_:primaryEmail a v:Email .
_:primaryEmail a v:Work .
_:primaryEmail v:email ?primaryEmail .
} WHERE {
?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasEmail ?email .
?email a v:Work .
}
}

17
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard5.sparql
View file

@ -1,17 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasTelephone _:telephone .
_:telephone a v:Telephone .
_:telephone a v:Voice .
_:telephone v:telephone ?phoneNumber .
} WHERE {
?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasTelephone ?telephoneNode .
}
}

19
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard6.sparql
View file

@ -1,19 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasTelephone _:primaryTelephone .
_:primaryTelephone a v:Telephone .
_:primaryTelephone a v:Voice .
_:primaryTelephone a v:Work .
_:primaryTelephone v:telephone ?primaryPhoneNumber .
} WHERE {
?s vivo:primaryPhoneNumber ?primaryPhoneNumber .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasTelephone ?telephoneNode .
?vcard a v:Work .
}
}

18
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard7.sparql
View file

@ -1,18 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasTelephone _:fax .
_:fax a v:Telephone .
_:fax a v:Fax.
_:fax v:telephone ?faxNumber .
} WHERE {
?s vivo:faxNumber ?faxNumber .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasTelephone ?faxNode .
?faxNode a v:Fax .
}
}

43
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard8.sparql
View file

@ -1,43 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasAddress ?address .
?address a v:Address .
?address v:streetAddress ?streetAddress .
?address v:locality ?addressCity .
?address v:region ?addressState .
?address v:postalCode ?addressPostalCode .
?address v:country ?addressCountry .
?address <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0001025> ?location .
?location <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0001015> ?address .
} WHERE {
?s vivo:mailingAddress ?address .
OPTIONAL { ?address vivo:addressCity ?addressCity }
OPTIONAL { ?address vivo:addressState ?addressState }
OPTIONAL { ?address vivo:addressPostalCode ?addressPostalCode }
OPTIONAL { ?address vivo:addressCountry ?addressCountry }
OPTIONAL { ?address vivo:hasGeographicLocation ?location }
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
OPTIONAL {
?address vivo:address1 ?address1 .
?address vivo:address2 ?address2 .
?address vivo:address3 ?address3 .
BIND (CONCAT(?address1, ", ", ?address2, ", ", ?address3) AS ?streetAddress)
}
OPTIONAL {
?address vivo:address1 ?address1 .
?address vivo:address2 ?address2 .
FILTER NOT EXISTS { ?address vivo:address3 ?address3 }
BIND (CONCAT(?address1, ", ", ?address2) AS ?streetAddress)
}
OPTIONAL {
?address vivo:address1 ?address1
BIND(?address1 as ?streetAddress)
}
FILTER NOT EXISTS {
?vcard v:hasAddress ?addressNode
}
}

19
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard9.sparql
View file

@ -1,19 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
CONSTRUCT {
?vcard v:hasURL ?webpage .
?webpage a v:URL .
?webpage v:url ?linkURI .
?webpage rdfs:label ?linkAnchorText
} WHERE {
?s vivo:webpage ?webpage .
?webpage vivo:linkURI ?linkURI .
?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
OPTIONAL {
?webpage vivo:linkAnchorText ?linkAnchorText
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/AdvisingRelationshipDel.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?advisor vivo:advisorIn ?advisingRelationship .
?advisingRelationship vivo:advisor ?advisor
} WHERE {
?advisor vivo:advisorIn ?advisingRelationship .
OPTIONAL {
?advisingRelationship vivo:advisor ?advisor
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/AdvisingRelationshipDel2.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?advisee vivo:adviseeIn ?advisingRelationship .
?advisingRelationship vivo:advisee ?advisee .
} WHERE {
?advisee vivo:adviseeIn ?advisingRelationship .
OPTIONAL {
?advisingRelationship vivo:advisee ?advisee .
}
}

14
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/EditorshipDel.sparql
View file

@ -1,14 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?person vivo:editorOf ?document .
?document vivo:editor ?person
} WHERE {
{
?person vivo:editorOf ?document
} UNION {
?document vivo:editor ?person
}
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/conceptDel.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX skos: <http://www.w3.org/2004/02/skos/core#>
CONSTRUCT {
?concept a owl:Thing .
} WHERE {
GRAPH ?g {
{ ?s vivo:hasResearchArea ?concept } UNION
{ ?s vivo:hasSubjectArea ?concept }
?concept a owl:Thing
} FILTER (!regex(str(?g), "kb-inf"))
}

11
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/grant-pre-del.sparql
View file

@ -1,11 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?role vivo:roleContributesTo ?grant .
?grant vivo:contributingRole ?role .
} WHERE {
?role vivo:roleContributesTo ?grant .
{ ?grant a vivo:Grant } UNION { ?grant a vivo:Contract }
}

10
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/orcidDel.sparql
View file

@ -1,10 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
CONSTRUCT {
?s vivo:orcidId ?orcidString .
} WHERE {
?s vivo:orcidId ?orcidString
FILTER(isLiteral(?orcidString))
FILTER (regex(str(?orcidString), "^[0-9][0-9][0-9][0-9]-[0-9][0-9][0-9][0-9]-[0-9][0-9][0-9][0-9]-[0-9][0-9][0-9]([0-9]|X)$"))
}

12
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/post/awardConferredDel.sparql
View file

@ -1,12 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?award vivo:assignedBy ?org .
?org vivo:assigns ?award .
} WHERE {
?org vivo:assigns ?award .
?award a vivo:Award .
?org a foaf:Organization .
}

13
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/post/awardedDegreeDel.sparql
View file

@ -1,13 +0,0 @@
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
CONSTRUCT {
?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002234> ?degree .
?degree <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002353> ?educationalProcess .
} WHERE {
?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002234> ?degree .
?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000056> ?educationalProcess .
?degree a vivo:AcademicDegree .
OPTIONAL { ?degree <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002353> ?educationalProcess }
}

131
productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/vcardDel.sparql
View file

@ -1,131 +0,0 @@
PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
PREFIX v: <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
CONSTRUCT {
?s foaf:firstName ?firstName .
?s foaf:lastName ?lastName .
?s vivo:middleName ?middleName .
?s bibo:prefixName ?prefix .
?s bibo:suffixName ?suffix .
?s vivo:email ?email .
?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail .
?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber .
?s vivo:primaryPhoneNumber ?primaryPhoneNumber .
?s vivo:faxNumber ?faxNumber .
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:mailingAddressFor ?s .
?address a ?addressType .
?address vivo:address1 ?address1 .
?address vivo:address2 ?address2 .
?address vivo:address3 ?address3 .
?address vivo:addressCity ?city .
?address vivo:addressState ?state .
?address vivo:addressPostalCode ?postalCode .
?address vivo:addressCountry ?country .
?address vivo:hasGeographicLocation ?location .
?location vivo:geographicLocationOf ?address .
?s vivo:webpage ?webpage .
?webpage vivo:webpageOf ?s .
?webpage vivo:linkAnchorText ?linkAnchorText .
?webpage vivo:linkURI ?linkURI .
?webpage a vivo:URLLink .
} WHERE {
{
?s foaf:firstName ?firstName .
}
UNION {
?s foaf:lastName ?lastName .
}
UNION {
?s vivo:middleName ?middleName .
?s a foaf:Person .
}
UNION {
?s bibo:prefixName ?prefix
}
UNION {
?s bibo:suffixName ?suffix
}
UNION {
?s vivo:email ?email
}
UNION {
?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail
}
UNION {
?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber
}
UNION {
?s vivo:primaryPhoneNumber ?primaryPhoneNumber
}
UNION {
?s vivo:faxNumber ?faxNumber
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
}
UNION {
?address vivo:mailingAddressFor ?s .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address a ?addressType
FILTER(regex(str(?addressType),"vivoweb.org/ontology/core"))
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:address1 ?address1 .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:address2 ?address2 .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:address3 ?address3 .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:addressCity ?city .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:addressState ?state .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:addressPostalCode ?postalCode .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:addressCountry ?country .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?address vivo:hasGeographicLocation ?location .
}
UNION {
?s vivo:mailingAddress ?address .
?location vivo:geographicLocationOf ?address .
}
UNION {
?s vivo:webpage ?webpage
}
UNION {
?webpage vivo:webpageOf ?s
}
UNION {
?s vivo:webpage ?webpage
}
UNION {
?s vivo:webpage ?webpage .
?webpage vivo:linkURI ?linkURI
}
UNION {
?s vivo:webpage ?webpage .
?webpage vivo:linkAnchorText ?linkAnchorText
}
}