Minor changes to hide additional eagle-i properties that are deprecated or involve classes not currently in VIVO
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1ed07aa8c8
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f7863669e8
2 changed files with 122 additions and 96 deletions
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@ -1324,37 +1324,38 @@ local:facilitySiteOfAgentConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ;
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vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean ;
|
vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean ;
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||||||
:propertyGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
|
:propertyGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
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local:projectUsesMaterialEntityContext a :ConfigContext ;
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# uses and used by need work -- apply to continuants and occurrents, and material entities as well as information content entities
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:hasConfiguration local:projectUsesMaterialEntityConfig ;
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#local:projectUsesMaterialEntityContext a :ConfigContext ;
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:configContextFor <http://purl.obolibrary.org/obo/ERO_0000031> ;
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# :hasConfiguration local:projectUsesMaterialEntityConfig ;
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:qualifiedByDomain vivo:Project ;
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# :configContextFor <http://purl.obolibrary.org/obo/ERO_0000031> ;
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:qualifiedBy <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000040> . ## Material Entity
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# :qualifiedByDomain vivo:Project ;
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# :qualifiedBy <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000040> . ## Material Entity
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local:projectUsesMaterialEntityConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ;
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#local:projectUsesMaterialEntityConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ;
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:listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ;
|
# :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ;
|
||||||
:displayName "uses equipment or instrument" ;
|
# :displayName "uses specimen, equipment, instrument, organism, reagent, or software" ;
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||||||
vitro:displayRankAnnot 85;
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# vitro:displayRankAnnot 85;
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vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ;
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# vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ;
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||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ;
|
# vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ;
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||||||
vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ;
|
# vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ;
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||||||
vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean ;
|
# vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean ;
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||||||
:propertyGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
|
# :propertyGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
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||||||
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||||||
local:materialEntityUsedByProjectContext a :ConfigContext ;
|
#local:materialEntityUsedByProjectContext a :ConfigContext ;
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||||||
:hasConfiguration local:MaterialEntityUsedByProjectConfig ;
|
# :hasConfiguration local:MaterialEntityUsedByProjectConfig ;
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||||||
:configContextFor <http://purl.obolibrary.org/obo/ERO_0000070> ;
|
# :configContextFor <http://purl.obolibrary.org/obo/ERO_0000070> ;
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||||||
:qualifiedByDomain <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000040> ; ## Material Entity
|
# :qualifiedByDomain <http://purl.obolibrary.org/obo/BFO_0000040> ; ## Material Entity
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||||||
:qualifiedBy vivo:Project .
|
# :qualifiedBy vivo:Project .
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||||||
local:materialEntityUsedByProjectConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ;
|
#local:materialEntityUsedByProjectConfig a :ObjectPropertyDisplayConfig ;
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||||||
:listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ;
|
# :listViewConfigFile "listViewConfig-default.xml"^^xsd:string ;
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||||||
:displayName "used by project" ;
|
# :displayName "used by project" ;
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||||||
vitro:displayRankAnnot 85;
|
# vitro:displayRankAnnot 85;
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||||||
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ;
|
# vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot role:public ;
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||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ;
|
# vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot role:public ;
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||||||
vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ;
|
# vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ;
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||||||
vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean ;
|
# vitro:selectFromExistingAnnot "true"^^xsd:boolean ;
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||||||
:propertyGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
|
# :propertyGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
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||||||
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||||||
local:facilityLocationOfEquipmentContext a :ConfigContext ;
|
local:facilityLocationOfEquipmentContext a :ConfigContext ;
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||||||
:hasConfiguration local:facilityLocationOfEquipmentConfig ;
|
:hasConfiguration local:facilityLocationOfEquipmentConfig ;
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||||||
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||||||
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@ -25,7 +25,8 @@ vivo:pmcid
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||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> .
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> .
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||||||
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||||||
obo:ERO_0000071
|
obo:ERO_0000071
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||||||
rdfs:label "Software"@en-US .
|
rdfs:label "Software"@en-US ;
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||||||
|
vitro:inClassGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroClassGrouppublications> .
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||||||
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||||||
bibo:Note
|
bibo:Note
|
||||||
rdfs:label "Note"@en-US ;
|
rdfs:label "Note"@en-US ;
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||||||
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|
@ -1648,7 +1649,7 @@ vivo:Contract
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||||||
"-1"^^xsd:int ;
|
"-1"^^xsd:int ;
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||||||
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
||||||
vitro:inClassGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroClassGroupresearch> ;
|
vitro:inClassGroup <http://vivoweb.org/ontology#vitroClassGrouppublications> ;
|
||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> .
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> .
|
||||||
|
|
||||||
|
|
@ -1868,22 +1869,22 @@ bibo:doi
|
||||||
bibo:accepted
|
bibo:accepted
|
||||||
rdfs:label "accepted"@en-US .
|
rdfs:label "accepted"@en-US .
|
||||||
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||||||
obo:ERO_0000070
|
obo:ERO_0000070 ## inverse of ERO_0000031
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||||||
rdfs:label "used by"@en-US ;
|
rdfs:label "used by"@en-US ;
|
||||||
vitro:displayLimitAnnot
|
# vitro:displayLimitAnnot
|
||||||
"2"^^xsd:int ;
|
# "2"^^xsd:int ;
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||||||
vitro:displayRankAnnot
|
# vitro:displayRankAnnot
|
||||||
"15"^^xsd:int ;
|
# "15"^^xsd:int ;
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||||||
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> ;
|
||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> .
|
||||||
vitro:inPropertyGroupAnnot
|
# vitro:inPropertyGroupAnnot
|
||||||
<http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
# <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
||||||
vitro:selectFromExistingAnnot
|
# vitro:selectFromExistingAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean ;
|
# "true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
# vitro:offerCreateNewOptionAnnot
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||||||
"true"^^xsd:boolean .
|
# "true"^^xsd:boolean .
|
||||||
|
|
||||||
vcard:Email
|
vcard:Email
|
||||||
rdfs:label "Email"@en-US .
|
rdfs:label "Email"@en-US .
|
||||||
|
|
@ -2660,20 +2661,20 @@ bibo:Website
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||||||
|
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||||||
obo:ERO_0001057
|
obo:ERO_0001057
|
||||||
rdfs:label "has preparation technique"@en-US ;
|
rdfs:label "has preparation technique"@en-US ;
|
||||||
vitro:displayLimitAnnot
|
# vitro:displayLimitAnnot
|
||||||
"2"^^xsd:int ;
|
# "2"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:displayRankAnnot
|
# vitro:displayRankAnnot
|
||||||
"53"^^xsd:int ;
|
# "53"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> ;
|
||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> .
|
||||||
vitro:inPropertyGroupAnnot
|
# vitro:inPropertyGroupAnnot
|
||||||
<http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
# <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
||||||
vitro:selectFromExistingAnnot
|
# vitro:selectFromExistingAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean ;
|
# "true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
# vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean .
|
# "true"^^xsd:boolean .
|
||||||
|
|
||||||
obo:BFO_0000003
|
obo:BFO_0000003
|
||||||
rdfs:label "Occurrent" .
|
rdfs:label "Occurrent" .
|
||||||
|
|
@ -3992,20 +3993,20 @@ obo:ERO_0000572
|
||||||
obo:RO_0001000
|
obo:RO_0001000
|
||||||
rdfs:label "derives from"@en-US ;
|
rdfs:label "derives from"@en-US ;
|
||||||
## note -- has a "some values from" restriction on Organism <http://purl.obolibrary.org/obo/OBI_0100026>
|
## note -- has a "some values from" restriction on Organism <http://purl.obolibrary.org/obo/OBI_0100026>
|
||||||
vitro:displayLimitAnnot
|
# vitro:displayLimitAnnot
|
||||||
"5"^^xsd:int ;
|
# "5"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:displayRankAnnot
|
# vitro:displayRankAnnot
|
||||||
"50"^^xsd:int ;
|
# "50"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> ;
|
||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> .
|
||||||
vitro:inPropertyGroupAnnot
|
# vitro:inPropertyGroupAnnot
|
||||||
<http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
# <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
||||||
vitro:selectFromExistingAnnot
|
# vitro:selectFromExistingAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean ;
|
# "true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
# vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean .
|
# "true"^^xsd:boolean .
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
bibo:gtin14
|
bibo:gtin14
|
||||||
|
|
@ -4063,7 +4064,17 @@ vcard:Fax
|
||||||
rdfs:label "Fax"@en-US .
|
rdfs:label "Fax"@en-US .
|
||||||
|
|
||||||
obo:ERO_0001521
|
obo:ERO_0001521
|
||||||
rdfs:label "human study performed by"@en-US .
|
rdfs:label "performed by organization"@en-US ;
|
||||||
|
vitro:displayRankAnnot
|
||||||
|
"20"^^xsd:int ;
|
||||||
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
||||||
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
||||||
|
vitro:offerCreateNewOptionAnnot "true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
|
vitro:inPropertyGroupAnnot
|
||||||
|
<http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
vivo:nihmsid
|
vivo:nihmsid
|
||||||
rdfs:label "NIH Manuscript Submission System ID"@en-US ;
|
rdfs:label "NIH Manuscript Submission System ID"@en-US ;
|
||||||
|
|
@ -4724,22 +4735,22 @@ vcard:hasLanguage
|
||||||
vcard:hasURL
|
vcard:hasURL
|
||||||
rdfs:label "has URL"@en-US .
|
rdfs:label "has URL"@en-US .
|
||||||
|
|
||||||
obo:ERO_0000482
|
obo:ERO_0000482 # deprecated
|
||||||
rdfs:label "uses software"@en-US ;
|
rdfs:label "uses software"@en-US ;
|
||||||
vitro:displayLimitAnnot
|
# vitro:displayLimitAnnot
|
||||||
"5"^^xsd:int ;
|
# "5"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:displayRankAnnot
|
# vitro:displayRankAnnot
|
||||||
"92"^^xsd:int ;
|
# "92"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> ;
|
||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> .
|
||||||
vitro:selectFromExistingAnnot
|
# vitro:selectFromExistingAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean ;
|
# "true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
# vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean ;
|
# "true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
vitro:inPropertyGroupAnnot
|
# vitro:inPropertyGroupAnnot
|
||||||
<http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
|
# <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> .
|
||||||
|
|
||||||
vivo:ResearchProposal
|
vivo:ResearchProposal
|
||||||
rdfs:label "Research Proposal"@en-US ;
|
rdfs:label "Research Proposal"@en-US ;
|
||||||
|
|
@ -6142,20 +6153,20 @@ vcard:Muse
|
||||||
|
|
||||||
obo:ERO_0000034
|
obo:ERO_0000034
|
||||||
rdfs:label "manufacturer"@en-US ;
|
rdfs:label "manufacturer"@en-US ;
|
||||||
vitro:displayLimitAnnot
|
# vitro:displayLimitAnnot
|
||||||
"2"^^xsd:int ;
|
# "2"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:displayRankAnnot
|
# vitro:displayRankAnnot
|
||||||
"73"^^xsd:int ;
|
# "73"^^xsd:int ;
|
||||||
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> ;
|
||||||
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#nobody> .
|
||||||
vitro:inPropertyGroupAnnot
|
# vitro:inPropertyGroupAnnot
|
||||||
<http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
# <http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
||||||
vitro:selectFromExistingAnnot
|
# vitro:selectFromExistingAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean ;
|
# "true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
# vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
||||||
"true"^^xsd:boolean .
|
# "true"^^xsd:boolean .
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
geo:area
|
geo:area
|
||||||
|
|
@ -6513,7 +6524,21 @@ vcard:hasRelated
|
||||||
rdfs:label "has related"@en-US .
|
rdfs:label "has related"@en-US .
|
||||||
|
|
||||||
obo:ERO_0000424
|
obo:ERO_0000424
|
||||||
rdfs:label "has study population"@en-US .
|
rdfs:label "has study population"@en-US ;
|
||||||
|
vitro:displayLimitAnnot
|
||||||
|
"5"^^xsd:int ;
|
||||||
|
vitro:displayRankAnnot
|
||||||
|
"15"^^xsd:int ;
|
||||||
|
vitro:hiddenFromDisplayBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
||||||
|
vitro:prohibitedFromUpdateBelowRoleLevelAnnot
|
||||||
|
<http://vitro.mannlib.cornell.edu/ns/vitro/role#public> ;
|
||||||
|
vitro:inPropertyGroupAnnot
|
||||||
|
<http://vivoweb.org/ontology#vitroPropertyGroupoverview> ;
|
||||||
|
vitro:selectFromExistingAnnot
|
||||||
|
"true"^^xsd:boolean ;
|
||||||
|
vitro:offerCreateNewOptionAnnot
|
||||||
|
"true"^^xsd:boolean .
|
||||||
|
|
||||||
obo:ARG_2000079
|
obo:ARG_2000079
|
||||||
rdfs:label "American Board of Pathology"@en-US .
|
rdfs:label "American Board of Pathology"@en-US .
|
||||||
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