various and sundry data migration changes

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/Editorship.sparql

@@ -0,0 +1,17 @@
+PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#> 
+PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#Thing> 
+PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
+
+CONSTRUCT {
+    ?person vivo:relatedBy _:Editorship .
+    _:Editorship a vivo:Editorship .
+    _:Editorship vivo:relates ?person .
+    _:Editorship vivo:relates ?document .
+    ?document vivo:relatedBy _:Editorship .
+} WHERE {
+    { 
+      ?person vivo:editorOf ?document
+    } UNION {
+      ?document vivo:editor ?person
+    }
+}

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/post/Grant.sparql

@@ -8,4 +8,5 @@ CONSTRUCT {
 } WHERE {
     ?agent <ihttp://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000053> ?role .
     ?role vivo:relatedBy ?grant
+    FILTER NOT EXISTS { ?grant vivo:relates ?agent } 
 }

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/additions/vcard2.sparql

@@ -2,6 +2,7 @@ PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
 PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/> 
 PREFIX v:   <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#> 
 PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#> 
+PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/>
 
 CONSTRUCT {
     ?vcard v:hasName _:name .
@@ -9,6 +10,8 @@ CONSTRUCT {
     _:name v:givenName ?firstName .
     _:name vivo:middleName ?middleName .
     _:name v:familyName ?lastName .
+    _:name v:honorificPrefix ?prefix .
+    _:name v:honorificSuffix ?suffix .
 } WHERE {
      ?s arg:ARG_2000028 ?vcard .
     OPTIONAL {
@@ -23,5 +26,11 @@ CONSTRUCT {
         ?s vivo:middleName ?middleName 
         BIND("yes" as ?test)
     } 
+    OPTIONAL {
+        ?s bibo:prefixName ?prefix 
+    }
+    OPTIONAL {
+        ?s bibo:suffixName ?suffix
+    }
     FILTER(bound(?test))
 }

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/EditorshipDel.sparql

@@ -0,0 +1,14 @@
+PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#> 
+PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#Thing> 
+PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
+
+CONSTRUCT {
+    ?person vivo:editorOf ?document .
+    ?document vivo:editor ?person
+} WHERE {
+    { 
+      ?person vivo:editorOf ?document
+    } UNION {
+      ?document vivo:editor ?person
+    }
+}

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/post/awardedDegreeDel.sparql

@@ -8,11 +8,13 @@ CONSTRUCT {
     ?educationalProcess vivo:relates ?org .
     ?org vivo:relatedBy ?educationalProcess .
 } WHERE {
+    ?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002234> ?degree .
+    ?person <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0000056> ?educationalProcess .
+    ?educationalProcess a vivo:EducationalProcess .
     ?educationalProcess <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002234> ?degree .
     OPTIONAL { ?degree <http://purl.obolibrary.org/obo/RO_0002353> ?educationalProcess }
     OPTIONAL {
         ?educationalProcess vivo:relates ?org .
         ?org a foaf:Organization . 
     }
-    ?degree a vivo:AcademicDegree .
 }

productMods/WEB-INF/ontologies/update/sparqlConstructs/deletions/vcardDel.sparql

@@ -2,11 +2,14 @@ PREFIX arg: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
 PREFIX foaf: <http://xmlns.com/foaf/0.1/>
 PREFIX v:   <http://www.w3.org/2006/vcard/ns#>
 PREFIX vivo: <http://vivoweb.org/ontology/core#>
+PREFIX bibo: <http://purl.org/ontology/bibo/> 
 
 CONSTRUCT {
         ?s foaf:firstName ?firstName .
         ?s foaf:lastName ?lastName .
         ?s vivo:middleName ?middleName .
+        ?s bibo:prefixName ?prefix .
+        ?s bibo:suffixName ?suffix .
         ?s vivo:email ?email .
         ?s vivo:primaryEmail ?primaryEmail . 
         ?s vivo:phoneNumber ?phoneNumber .
@@ -25,6 +28,12 @@ CONSTRUCT {
     } 
     UNION {
         ?s vivo:middleName ?middleName 
+    }
+    UNION {
+        ?s bibo:prefixName ?prefix 
+    } 
+    UNION {
+        ?s bibo:suffixName ?suffix
     } 
     UNION {
         ?s vivo:email ?email